RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 NT5C3BQ969T7 300 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 DBNDD1Q9H9R9 158 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 C6orf50Q9HD87 102 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAB20Q9NX57 234 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 ANXA10Q9UJ72 324 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 HHLA2Q9UM44 414 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 CHD5Q8TDI0 1954 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 MTUS2Q5JR59 1369 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 LINC00862A6NCI5 91 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 H3BN98 237 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 CPLX1O14810 134 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 FGF16O43320 207 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 MTX2O75431 263 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 FCN3O75636 299 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR2F2O95006 317 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 GUCA1CO95843 209 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 FBP1P09467 338 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATP6V0CP27449 155 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 PSMB8P28062 276 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 TSPOP30536 169 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 HSPA13P48723 471 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 RBM11P57052 281 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAB25P57735 213 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAB2AP61019 212 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 GAPTQ8N292 157 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 UBE2J2Q8N2K1 259 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMEM156Q8N614 296 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 TEX9Q8N6V9 391 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 GALMQ96C23 342 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 VAT1Q99536 393 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRSS27Q9BQR3 290 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 YIPF3Q9GZM5 350 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 DEFB129Q9H1M3 183 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 DCSTAMPQ9H295 470 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC38A1Q9H2H9 487 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 ANKRA2Q9H9E1 313 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 SCN3AQ9NY46 2000 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 M0R1B8 84 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 UBDO15205 165 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 GMFGO60234 142 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 PDCD6O75340 191 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 GCGP01275 180 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 BRS3P32247 399 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 OPRM1P35372 400 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 STC1P52823 247 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 MP68P56378 58 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR4D2P58180 307 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 XRCC4Q13426 336 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 MPV17LQ2QL34 196 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 DHFR2Q86XF0 187 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 CLECL1Q8IZS7 167 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 GATD1Q8NB37 220 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 PLPP5Q8NEB5 264 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 C20orf24Q9BUV8 137 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 EBPLQ9BY08 206 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 CHST6Q9GZX3 395 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 PROK2Q9HC23 129 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 ADA2Q9NZK5 511 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 TAAR3PQ9P1P4 343 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 CFL2Q9Y281 166 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 TIMM9Q9Y5J7 89 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 FANCMQ8IYD8 2048 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 PKD1P98161 4303 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 B4DEV8 164 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 C5orf67F2Z3F1 127 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 H3BSA7 217 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 TXNDC9O14530 226 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 NDUFB2O95178 105 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 FTH1P02794 183 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC2A1P11166 492 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 STOMP27105 288 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM27BQ5VT28 67 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 LPCAT4Q643R3 524 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 CASC1Q6TDU7 716 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-90P-201ENST00000606352 SCD5Q86SK9 330 aa-1.32□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms