RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601252.1

TIMM50-215, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 5

Gene TIMM50, Length 1,737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-215ENST00000601252 GPHA2Q96T91 129 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 UFSP2Q9NUQ7 469 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 JKAMPQ9P055 326 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 DUSP13Q9UII6 198 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 FBXO7Q9Y3I1 522 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 BSNQ9UPA5 3926 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 CADP27708 2225 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 ITPR1Q14643 2758 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 A0A0G2JRQ6 117 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 C7orf77A4D0Y5 90 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 SRRM5B3KS81 715 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 C16orf97H3BN30 126 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 PSPNO60542 156 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 IGKV1-39P01597 117 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 IGKV1D-39P04432 117 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 IFNA4P05014 189 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 NFYBP25208 207 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 CD40P25942 277 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 GABRA2P47869 451 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 OR3A1P47881 315 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 ASCL1P50553 236 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 HTD2P86397 168 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 ZNF585BQ52M93 769 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 ZNF506Q5JVG8 444 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 ALKBH2Q6NS38 261 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 C5orf24Q7Z6I8 188 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 ODF3L1Q8IXM7 274 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 NUP37Q8NFH4 326 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 RXFP4Q8TDU9 374 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 OR2D2Q9H210 308 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 TIMM9Q9Y5J7 89 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 TANC2Q9HCD6 1990 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 C1orf196B1AJZ1 125 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 C12orf77C9JDV5 145 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 IFNA1P01562 189 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 IGKV1-5P01602 117 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 KRBOX4Q5JUW0 171 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 TMEM108Q6UXF1 575 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 LRP11Q86VZ4 500 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 FGFRL1Q8N441 504 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-215ENST00000601252 COLCA2A8K830 154 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 SOX15O60248 233 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 HBZP02008 142 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 PTAFRP25105 342 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 UBE2KP61086 200 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 SPSB3Q6PJ21 355 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 THNSL2Q86YJ6 484 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 C14orf79Q96F83 325 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 MEGF10Q96KG7 1140 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 NBEAQ8NFP9 2946 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 DSCAML1Q8TD84 2053 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 RAB29O14966 203 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 GPR37O15354 613 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 CLDN14O95500 239 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 CRYBA1P05813 215 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 FAM87AP0C7U9 286 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 C1QTNF9P0C862 333 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 GZMHP20718 246 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 GATA4P43694 442 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 TNFRSF9Q07011 255 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 VHLLQ6RSH7 139 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 LINC00518Q8N0U6 118 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 ZNF561Q8N587 486 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 ZNF525Q8N782 197 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 SFT2D1Q8WV19 159 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 COQ2Q96H96 371 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 OR2V2Q96R30 315 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 A0A087WWC5 75 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 B4DEV8 164 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 PPIHO43447 177 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 NXPH3O95157 252 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 MBP02144 154 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 COL10A1Q03692 680 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 AESQ08117 197 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 Q6ZRM9 215 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 OR1L1Q8NH94 360 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 P2RX4Q99571 388 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 JPT1Q9UK76 154 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-215ENST00000601252 PKD1L2Q7Z442 2459 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms