RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 LFNGQ8NES3 379 aa21.19■□□□□ 0.98
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CAPNS1-204ENST00000587718 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
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CAPNS1-204ENST00000587718 SULT1A1P50225 295 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-204ENST00000587718 PEA15Q15121 130 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-204ENST00000587718 KRBOX4Q5JUW0 171 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-204ENST00000587718 OR1L1Q8NH94 360 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP5SQ99766 215 aa21.12■□□□□ 0.97
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