RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 GPR12P47775 334 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 FXYD4P59646 89 aa9.31□□□□□ -0.92
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GGA3-211ENST00000582232 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 BRD3OSQ6XYD6 125 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 DRAM1Q8N682 238 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 ZFAND1Q8TCF1 268 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 SECTM1Q8WVN6 248 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 TOMM40LQ969M1 308 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 CCL28Q9NRJ3 127 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 COPZ2Q9P299 210 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 A0A1W2PRD5 423 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 A0A1W2PRF3 423 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 A0A1W2PRM7 423 aa9.3□□□□□ -0.92
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GGA3-211ENST00000582232 RND3P61587 244 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
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GGA3-211ENST00000582232 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa9.3□□□□□ -0.92
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GGA3-211ENST00000582232 ZDHHC22Q8N966 263 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.3□□□□□ -0.92
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GGA3-211ENST00000582232 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 RPEQ96AT9 228 aa9.3□□□□□ -0.92
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GGA3-211ENST00000582232 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 A0A0U1RQK1 487 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa9.29□□□□□ -0.92
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GGA3-211ENST00000582232 DUTP33316 252 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
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GGA3-211ENST00000582232 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 SCGB2A2Q13296 93 aa9.29□□□□□ -0.92
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GGA3-211ENST00000582232 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 CMTM1Q8IZ96 169 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 DYNAPQ8N1N2 210 aa9.29□□□□□ -0.92
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GGA3-211ENST00000582232 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 VSIG4Q9Y279 399 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 A0A1W2PPI3 338 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 M0R1X1 148 aa9.28□□□□□ -0.92
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GGA3-211ENST00000582232 TCRBP04435 133 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 CT45A6P0DMU7 189 aa9.28□□□□□ -0.92
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GGA3-211ENST00000582232 CT45A7P0DMV0 189 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 S100GP29377 79 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 ARHGDIBP52566 201 aa9.28□□□□□ -0.92
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GGA3-211ENST00000582232 IL17RELQ6ZVW7 336 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 OR5AN1Q8NGI8 311 aa9.28□□□□□ -0.92
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GGA3-211ENST00000582232 NABP2Q9BQ15 211 aa9.28□□□□□ -0.92
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GGA3-211ENST00000582232 OCEL1Q9H607 264 aa9.28□□□□□ -0.92
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GGA3-211ENST00000582232 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 FAM96BQ9Y3D0 163 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 HILPDAQ9Y5L2 63 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-211ENST00000582232 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 LINC00473A8K010 186 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 RNF212BA8MTL3 300 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 CD1BP29016 333 aa9.27□□□□□ -0.93
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GGA3-211ENST00000582232 REG1BP48304 166 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 THBS3P49746 956 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 PIGPP57054 158 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
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