RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CABLES2Q9BTV7 478 aa20.22■□□□□ 0.83
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TREM2Q9NZC2 230 aa20.19■□□□□ 0.82
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM90A2PQ658T7 463 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CACNG5Q9UF02 275 aa20.16■□□□□ 0.82
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRRC29Q8WV35 223 aa20.15■□□□□ 0.82
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GNG13Q9P2W3 67 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C3orf36Q3SXR2 165 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GGACTQ9BVM4 153 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TOLLIPQ9H0E2 274 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1B0GWJ7 208 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SYNGR2O43760 224 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMPRSS3P57727 454 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF674Q2M3X9 581 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRGPRGQ86SM5 289 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF525Q8N782 197 aa20.14■□□□□ 0.81
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