RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256		H0YJW9	148 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	NBR2	O15453	112 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	RBBP9	O75884	186 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	TFAP2A	P05549	437 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	OR8U9	P0C7N5	309 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	STPG2	Q8N412	459 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	GON7	Q9BXV9	100 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	KIAA1456	Q9P272	454 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	GAB2	Q9UQC2	676 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256		H7C2Y5	167 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	PROP1	O75360	226 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	NCS1	P62166	190 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF329	Q86UD4	541 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	NPB	Q8NG41	125 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	R3HDM4	Q96D70	268 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	RITA1	Q96K30	269 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	RNF5	Q99942	180 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	OR2D2	Q9H210	308 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	LINC01548	A6NM66	108 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256		M0R1X1	148 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	SSX5	O60225	188 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	NDUFA3	O95167	84 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	HLA-DRB1	P01911	266 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	APOA2	P02652	100 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	CNTFR	P26992	372 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	CNIH2	Q6PI25	160 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF580	Q9UK33	172 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATG13-223	ENST00000577256		A0A1W2PRX2	142 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	XRCC3	O43542	346 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	VBP1	P61758	197 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	PDPN	Q86YL7	162 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF383	Q8NA42	475 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	RRH	O14718	337 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	IGF1	P05019	195 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	PF4V1	P10720	104 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	LIN54	Q6MZP7	749 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	TEX38	Q6PEX7	206 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	GABARAP	O95166	117 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	OR5H8	P0DN80	308 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	VDAC1	P21796	283 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	CBX5	P45973	191 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	PLGLA	Q15195	96 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	BEST4	Q8NFU0	473 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	ZFP57	Q9NU63	452 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	PLXNB1	O43157	2135 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	SLC22A5	O76082	557 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	SPDEF	O95238	335 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	THBS3	P49746	956 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	LINC00205	P59089	165 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	ARPC4	P59998	168 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	CTF1	Q16619	201 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	GPR141	Q7Z602	305 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	CMTM3	Q96MX0	182 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	OR51J1	Q9H342	316 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	FBXL15	Q9H469	300 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	NOTCH1	P46531	2555 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATG13-223	ENST00000577256	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		13.85	□□□□□ -0.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms