RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569222.5

KIFC3-233, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 3

Gene KIFC3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-233	ENST00000569222	S1PR3	Q99500	378 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	GAB2	Q9UQC2	676 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	NDUFA3	O95167	84 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	IGHG2	P01859	326 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	HLA-DQB1	P01920	261 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	ELK1	P19419	428 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	LINC00205	P59089	165 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	CNIH2	Q6PI25	160 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	BEST4	Q8NFU0	473 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	PHF21A	Q96BD5	680 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	OR2D2	Q9H210	308 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	RNF150	Q9ULK6	438 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222		H3BMQ9	156 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	HPGDS	O60760	199 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	IGLV2-14	P01704	120 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	CTXN2	P0C2S0	81 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	OR8U9	P0C7N5	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	NAT1	P18440	290 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	CNTFR	P26992	372 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	GPR12	P47775	334 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	ACTB	P60709	375 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	NPB	Q8NG41	125 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	OR8U1	Q8NH10	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	AP3S1	Q92572	193 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	GINS4	Q9BRT9	223 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	ZNF580	Q9UK33	172 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	PLXNB1	O43157	2135 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	IGKV1-16	P04430	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	CBX5	P45973	191 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	MMD	Q15546	238 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	GPX8	Q8TED1	209 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	DDB2	Q92466	427 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	ISOC1	Q96CN7	298 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	ZNF221	Q9UK13	617 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	LINC01548	A6NM66	108 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222		M0R1X1	148 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	NBR2	O15453	112 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	FBXO24	O75426	580 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	RBBP9	O75884	186 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	TSPAN15	O95858	294 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	HLA-DRB1	P01911	266 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	CD28	P10747	220 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	CFHR3	Q02985	330 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	SCOC	Q9UIL1	159 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	MC5R	P33032	325 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	NDP	Q00604	133 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	CD83	Q01151	205 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	PDPN	Q86YL7	162 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	LAX1	Q8IWV1	398 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KIFC3-233	ENST00000569222	LINC00473	A8K010	186 aa		10.58	□□□□□ -0.72
KIFC3-233	ENST00000569222		M0QZ24	198 aa		10.58	□□□□□ -0.72
KIFC3-233	ENST00000569222	TPPP	O94811	219 aa		10.58	□□□□□ -0.72
KIFC3-233	ENST00000569222	SPDEF	O95238	335 aa		10.58	□□□□□ -0.72
KIFC3-233	ENST00000569222	IGLV2-23	P01705	113 aa		10.58	□□□□□ -0.72
KIFC3-233	ENST00000569222	IGF1	P05019	195 aa		10.58	□□□□□ -0.72
KIFC3-233	ENST00000569222	AADAC	P22760	399 aa		10.58	□□□□□ -0.72
KIFC3-233	ENST00000569222	PRSS3	P35030	304 aa		10.58	□□□□□ -0.72
KIFC3-233	ENST00000569222	SOX6	P35712	828 aa		10.58	□□□□□ -0.72
KIFC3-233	ENST00000569222	ARPC4	P59998	168 aa		10.58	□□□□□ -0.72
KIFC3-233	ENST00000569222	MSMO1	Q15800	293 aa		10.58	□□□□□ -0.72

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