RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.35□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.35□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 J3QR06 171 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 CXCL3P19876 107 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 CLLU1Q5K131 121 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 PHYHIPQ92561 330 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 DUSP21Q9H596 190 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 TUBD1Q9UJT1 453 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 FXYD1O00168 92 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 INSP01308 110 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 CST9LQ9H4G1 147 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 RASL12Q9NYN1 266 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 LEUTXA8MZ59 168 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 LILRA1O75019 489 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 CTAG2O75638 210 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 IGHV3-53P01767 116 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 SOD3P08294 240 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 CD37P11049 281 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 SEC11CQ9BY50 192 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 K7N7A8 449 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 M0R381 172 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 CD8AP01732 235 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 NCMAPQ5T1S8 102 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 MSRB3Q8IXL7 192 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 SIGLEC7Q9Y286 467 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 TAAR5O14804 337 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 APCSP02743 223 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 KHDC3LQ587J8 217 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.34□□□□□ -1.23
PDPR-210ENST00000568530 VENTXO95231 258 aa7.34□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 SP9P0CG40 484 aa7.34□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 TSPOP30536 169 aa7.34□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 TEX30Q5JUR7 227 aa7.34□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 TMEM42Q69YG0 159 aa7.34□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.34□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 FAM60AQ9NP50 221 aa7.34□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.34□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 AP4M1O00189 453 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 IL11P20809 199 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 MC5RP33032 325 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 PIGYQ3MUY2 71 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 SCNM1Q9BWG6 230 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 CA2P00918 260 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 STAG3L2P0CL84 134 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.247e-8■■□□□ 13
PDPR-210ENST00000568530 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 CBLN3Q6UW01 205 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 MVB12AQ96EY5 273 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 PAXXQ9BUH6 204 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 MMP26Q9NRE1 261 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 ADAP1O75689 374 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 ZFPL1O95159 310 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 ZP3P21754 424 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 PRDX2P32119 198 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 PLPP3O14495 311 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 SOCS1O15524 211 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 CNTFRP26992 372 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 IER3P46695 156 aa7.33□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.33□□□□□ -1.24
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