RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	SSX7	Q7RTT5	188 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	TAAR6	Q96RI8	345 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	USF3	Q68DE3	2245 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	ODAM	A1E959	279 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	RAB29	O14966	203 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CYB5B	O43169	146 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF737	O75373	536 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	KITLG	P21583	273 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	GABRA2	P47869	451 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	PMP22	Q01453	160 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	WNT9B	O14905	357 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	MZT1	Q08AG7	82 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	WDR82	Q6UXN9	313 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	COQ2	Q96H96	371 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	WASF3	Q9UPY6	502 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CACNA1D	Q01668	2161 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	S1PR2	O95136	353 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	OPN1MW	P04001	364 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	WDR31	Q8NA23	367 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	DTD1	Q8TEA8	209 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	FAM210B	Q96KR6	192 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	DOK5	Q9P104	306 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		15.42	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	LY86	O95711	162 aa		15.42	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	PAX5	Q02548	391 aa		15.42	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		15.42	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		15.42	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		15.42	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	C5orf30	Q96GV9	206 aa		15.42	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		15.42	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	GTF3C1	Q12789	2109 aa		15.42	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	AQP7	O14520	342 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	SPINT2	O43291	252 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	S100A2	P29034	98 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	GCH1	P30793	250 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	PSMB3	P49720	205 aa		15.41	■□□□□ 0.06
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RRN3-205	ENST00000563559	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	NAT8	Q9UHE5	227 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	C17orf98	A8MV24	154 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM250	H0YL14	139 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
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RRN3-205	ENST00000563559	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	HTD2	P86397	168 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF709	Q8N972	641 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CLN8	Q9UBY8	286 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CACNA1G	O43497	2377 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H2BK	O60814	126 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	YIF1A	O95070	293 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	AGFG2	O95081	481 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H2BO	P23527	126 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H2BB	P33778	126 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H2BD	P58876	126 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H2BC	P62807	126 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	SARAF	Q96BY9	339 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	MIOX	Q9UGB7	285 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		15.4	■□□□□ 0.06

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