RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		17.01	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200		G3V318	75 aa		17.01	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP6V0E1	O15342	81 aa		17.01	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	CD3G	P09693	182 aa		17.01	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	17.01	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	GNB3	P16520	340 aa		17.01	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMB9	P28065	219 aa		17.01	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	KIR2DS1	Q14954	304 aa		17.01	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	DUX3	Q96PT4	197 aa		17.01	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	RDH8	Q9NYR8	311 aa		17.01	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF150	Q9ULK6	438 aa		17.01	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		17.01	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	COL7A1	Q02388	2944 aa		17	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL24	O00175	119 aa		17	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	FABP7	O15540	132 aa		17	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV1-40	P01703	118 aa		17	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	17	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		17	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1456	Q9P272	454 aa		17	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	STUB1	Q9UNE7	303 aa		17	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		17	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	RRH	O14718	337 aa		16.99	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	RBBP9	O75884	186 aa		16.99	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	DIRAS3	O95661	229 aa		16.99	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	GADD45A	P24522	165 aa		16.99	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINB10	P48595	397 aa		16.99	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00205	P59089	165 aa		16.99	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	NDP	Q00604	133 aa		16.99	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB136	Q30KP8	78 aa		16.99	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		16.99	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	IGSF11	Q5DX21	431 aa		16.99	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	16.99	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF5	Q99942	180 aa		16.99	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	KLK15	Q9H2R5	256 aa		16.99	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		16.99	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		16.98	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM30	A4D0T7	59 aa		16.98	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		16.98	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	NOTO	A8MTQ0	251 aa		16.98	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	GSTT2	P0CG29	244 aa		16.98	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	GSTT2B	P0CG30	244 aa		16.98	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	16.98	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	16.98	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF773	Q6PK81	442 aa		16.98	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF383	Q8NA42	475 aa		16.98	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		16.98	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8U1	Q8NH10	309 aa		16.98	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		16.98	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXL15	Q9H469	300 aa		16.98	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	PARP11	Q9NR21	331 aa		16.98	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	16.98	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A075B6Q4	140 aa		16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200		H7C2Y5	167 aa		16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200		K7EIL1	84 aa		16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	FCN1	O00602	326 aa		16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1-16	P04430	117 aa		16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	CX3CL1	P78423	397 aa		16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	FHL3	Q13643	280 aa		16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZS49	121 aa		16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	TPRA1	Q86W33	373 aa		16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF221	Q9UK13	617 aa		16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	GAB2	Q9UQC2	676 aa		16.97	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	16.96	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	16.96	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	16.96	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		16.96	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	16.96	■□□□□ 0.31
PPP4C-205	ENST00000563200	BET1	O15155	118 aa		16.96	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	TFAP2A	P05549	437 aa		16.96	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	16.96	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		16.96	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		16.96	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		16.96	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		16.96	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	OR51E2	Q9H255	320 aa		16.96	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	16.96	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		16.95	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		16.95	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	PSG5	Q15238	335 aa		16.95	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	C5orf30	Q96GV9	206 aa		16.95	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	GNB4	Q9HAV0	340 aa		16.95	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		16.95	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	SSR3	Q9UNL2	185 aa		16.95	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		16.95	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200		I3L521	148 aa		16.94	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200		M0R1X1	148 aa		16.94	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	SOX15	O60248	233 aa		16.94	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8U9	P0C7N5	309 aa		16.94	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB9A	P51151	201 aa		16.94	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	RUNX1	Q01196	453 aa		16.94	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL6IP1	Q15041	203 aa		16.94	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		16.94	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	PDPN	Q86YL7	162 aa		16.94	■□□□□ 0.3

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