RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556470.1

PPP4R4-205, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, human

TSL 4

Gene PPP4R4, Length 589 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R4-205	ENST00000556470	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470		K7ENP7	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470		K7N7A8	449 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	F2RL2	O00254	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	TSPAN4	O14817	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	WNT9B	O14905	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	ZNF737	O75373	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	CLDN1	O95832	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	LHB	P01229	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	CD55	P08174	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	CD40	P25942	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	PAX6	P26367	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	GPR12	P47775	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	DYNLT3	P51808	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	TDGF1P3	P51864	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	ERVK-16	P61578	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	CLINT1	Q14677	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	FAM222B	Q8WU58	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	WFDC1	Q9HC57	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	CACNA1G	O43497	2377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	NCOR1	O75376	2440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470		A0A0C4DFX4	3053 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	HPRT1	P00492	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	IFNA1	P01562	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	MB	P02144	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470		P0C879	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	BMP5	P22003	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	OMG	P23515	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	CD80	P33681	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	GLIPR1	P48060	266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	CASP6	P55212	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	PAX9	P55771	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	UBE2K	P61086	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	RHEB	Q15382	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	GUK1	Q16774	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470		Q3ZCU0	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPP4R4-205	ENST00000556470	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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