RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	SHF	Q7M4L6	423 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	SSX9	Q7RTT3	188 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	CROCCP2	Q86T23	111 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	PHB2	Q99623	299 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	TM2D1	Q9BX74	207 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	SPDEF	O95238	335 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	HBZ	P02008	142 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF3	P17036	446 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	RBP2	P50120	134 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	DAD1	P61803	113 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	GK3P	Q14409	553 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	STEAP3	Q658P3	488 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	CGREF1	Q99674	301 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	XCL2	Q9UBD3	114 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	AASS	Q9UDR5	926 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	OR5H14	A6NHG9	310 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	UBD	O15205	165 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	RBBP9	O75884	186 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	CLEC3B	P05452	202 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	MTCP1	P56278	107 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	LIPE	Q05469	1076 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617		F5H768	121 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	CCL1	P22362	96 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	GPR183	P32249	361 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	SELENOW	P63302	87 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ODF4	Q2M2E3	257 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	PIGY	Q3MUY2	71 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF529	Q6P280	563 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	NEU1	Q99519	415 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	7.47	□□□□□ -1.21
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1W2PRQ8	180 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM189	A5PLL7	270 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	ST8SIA5	O15466	376 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	GMNN	O75496	209 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	ALOX5AP	P20292	161 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	SOX2	P48431	317 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	DGCR6	Q14129	220 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617		Q8N814	137 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	OR14A2	Q96R54	314 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	RNF5	Q99942	180 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	MPPED1	O15442	326 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	SNX3	O60493	162 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	MT-ND4	P03905	459 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	CRYGC	P07315	174 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	KIT	P10721	976 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	KDELR2	P33947	212 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ABCD4-222	ENST00000555617	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		7.44	□□□□□ -1.22

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