RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549815.1

GCN1-206, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, human

TSL 3

Gene GCN1, Length 543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCN1-206	ENST00000549815	VEGFC	P49767	419 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	CX3CL1	P78423	397 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	RAB11B	Q15907	218 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	TMEM65	Q6PI78	240 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	RNF5	Q99942	180 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	TENM3	Q9P273	2699 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	SHISA3	A0PJX4	238 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	RBBP9	O75884	186 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	OR8U8	P0C7N1	319 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	LINC00205	P59089	165 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	ZNF616	Q08AN1	781 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	SSX1	Q16384	188 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	ECSCR	Q19T08	205 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	PRR25	Q96S07	402 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	GAB2	Q9UQC2	676 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815		V9GY05	133 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815		A0A1W2PN81	502 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	CHRNA7	P36544	502 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	ECI1	P42126	302 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	ZNF383	Q8NA42	475 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	OR5B12	Q96R08	314 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	RNF150	Q9ULK6	438 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-206	ENST00000549815	TRDC	B7Z8K6	153 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	HSPA12A	O43301	675 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	IGKV1-16	P04430	117 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	INSL3	P51460	131 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	PSG5	Q15238	335 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	HES5	Q5TA89	166 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	DCUN1D4	Q92564	292 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	RDH8	Q9NYR8	311 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	SORL1	Q92673	2214 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815		H7C2Y5	167 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	SPDEF	O95238	335 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	CA2	P00918	260 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	PSMD7	P51665	324 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	OR10A3	P58181	314 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	PDPN	Q86YL7	162 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	RAB22A	Q9UL26	194 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	RYR2	Q92736	4967 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815		A0A087WW49	117 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	RAB27B	O00194	218 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	MFNG	O00587	321 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	OVOL1	O14753	267 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	FABP7	O15540	132 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	TFAP2A	P05549	437 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	FCGR3A	P08637	254 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	CD3G	P09693	182 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	RANBP1	P43487	201 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	SLURP1	P55000	103 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	PLGLA	Q15195	96 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GCN1-206	ENST00000549815	ZNF429	Q86V71	674 aa		10.37	□□□□□ -0.75

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