RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ST8SIA2Q92186 375 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 GPR146Q96CH1 333 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 BCL2L11O43521 198 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 FCGR3BO75015 233 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 PROP1O75360 226 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 S1PR2O95136 353 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ZNF345Q14585 488 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 NMSQ5H8A3 153 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 GSX2Q9BZM3 304 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 JPT1Q9UK76 154 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 NSG2Q9Y328 171 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CHD6Q8TD26 2715 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 IGKV1-5P01602 117 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 HKR1P10072 659 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TMEM33P57088 247 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 NHLH2Q02577 135 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CATR1Q13166 79 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 NDUFA5Q16718 116 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 SPIN2AQ99865 258 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CHST1O43916 411 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CST7O76096 145 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 PAX5Q02548 391 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 RNF212BA8MTL3 300 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 E5RGE8 158 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 F2RL2O00254 374 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 YPEL1O60688 119 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 FBXO24O75426 580 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 SNAPC5O75971 98 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CGB3P0DN86 165 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CGB7P0DN87 165 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 IAPPP10997 89 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 REG1BP48304 166 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 VAMP2P63027 116 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CLINT1Q14677 625 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 SPINK9Q5DT21 86 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TMED6Q8WW62 240 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ZNF714Q96N38 554 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 YPEL2Q96QA6 119 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 PTPN13Q12923 2485 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 VPS13CQ709C8 3753 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 RNF224P0DH78 156 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 DAOP14920 347 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 AQP10Q96PS8 301 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 FBXL17Q9UF56 701 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.94□□□□□ -1.3
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CS-215ENST00000549143 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TMEM50AO95807 157 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CR1LQ2VPA4 569 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 BAP18Q8IXM2 172 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 OR2C3Q8N628 320 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CXorf58Q96LI9 332 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 MARCH11A6NNE9 402 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 RAB29O14966 203 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CRYZL1O95825 349 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 DANCRP0C864 163 aa6.92□□□□□ -1.3
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