RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	LRRC6	Q86X45	466 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	CYGB	Q8WWM9	190 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	ACY3	Q96HD9	319 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	VCX3B	Q9H321	246 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	OR51B6	Q9H340	312 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	RTTN	Q86VV8	2226 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	BHLHE40	O14503	412 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	PSMG1	O95456	288 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	NQO2	P16083	231 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	AKR1C3	P42330	323 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	CTBP2	P56545	445 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	CARD18	P57730	90 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	TAS2R30	P59541	319 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	HOXC5	Q00444	222 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	HBEGF	Q99075	208 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	UBE2L6	O14933	153 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	SGCE	O43556	437 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	UGT2B11	O75310	529 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	NDUFB2	O95178	105 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	LIMS3	P0CW19	117 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	LIMS4	P0CW20	117 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	CCL2	P13500	99 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	CCR7	P32248	378 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	STC1	P52823	247 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	TNNC1	P63316	161 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	XKRX	Q6PP77	449 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	RORB	Q92753	470 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	FAM210A	Q96ND0	272 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	GLS2	Q9UI32	602 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-233	ENST00000545204	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	ROS1	P08922	2347 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	SCN9A	Q15858	1988 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	CIAO1	O76071	339 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	NPY	P01303	97 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	AGTR1	P30556	359 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	SLC36A2	Q495M3	483 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	CNPY4	Q8N129	248 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	MED9	Q9NWA0	146 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	NDUFS8	O00217	210 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	CRP	P02741	224 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	OR10J1	P30954	320 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	IFNGR2	P38484	337 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	CA7	P43166	264 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	PSMD7	P51665	324 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	HERVK_113	P63121	156 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	CDK5R1	Q15078	307 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	MEST	Q5EB52	335 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM56	Q96MV1	263 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	ODF3	Q96PU9	254 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	OR7D2	Q96RA2	312 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	DOHH	Q9BU89	302 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	KIAA0232	Q92628	1395 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	MUC5AC	P98088	5654 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	GRIN2B	Q13224	1484 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204		F5H5K5	113 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204		H0YC42	278 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	TXNDC9	O14530	226 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	MRAS	O14807	208 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	ARL6IP5	O75915	188 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	ADORA1	P30542	326 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	CCR2	P41597	374 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	DAD1	P61803	113 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	OR4D1	Q15615	310 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-233	ENST00000545204	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		0.38	□□□□□ -2.35

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