RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYYR1Q96J86 154 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF126Q9BV68 326 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 S4R3C0 116 aa7.42□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 J3QL48 77 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPPED1O15442 326 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBBP9O75884 186 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFNA21P01568 189 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFNA17P01571 189 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAS1P04201 325 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINA2P20848 420 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRKACGP22612 351 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MED21Q13503 144 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CGB2Q6NT52 195 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2G2Q8NGZ5 317 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM68Q96MH6 324 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALG8Q9BVK2 526 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFT22Q9H7X7 185 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF556Q9HAH1 456 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa7.41□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.41□□□□□ -1.22
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PP11 408 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM223BA6NKX1 122 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNX3O60493 162 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SULT1C4O75897 302 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2J3O76001 311 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR9G9P0C7N8 305 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C15orf32Q32M92 178 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF5Q99942 180 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 JPT1Q9UK76 154 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB21Q9UL25 225 aa7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB29O14966 203 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YPEL1O60688 119 aa7.39□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ISG15P05161 165 aa7.39□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARL3P36405 182 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP6V1E1P36543 226 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPHB5Q86YW7 130 aa7.39□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YPEL2Q96QA6 119 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL4I1Q96RQ9 567 aa7.39□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 METTL9Q9H1A3 318 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HRH4Q9H3N8 390 aa7.39□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.39□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.38□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPDEFO95238 335 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AMBPP02760 352 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2T7P0C7T2 308 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HTD2P86397 168 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM187Q14656 261 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPV17LQ2QL34 196 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AADACL4Q5VUY2 407 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB12Q6IQ22 244 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PELI1Q96FA3 418 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NSL1Q96IY1 281 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 S100A13Q99584 98 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.38□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNGT2O14610 69 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CST1P01037 141 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HTR1AP08908 422 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB3AP20336 220 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EPHA2P29317 976 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP2K4P45985 399 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNXAQ16473 311 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.37□□□□□ -1.23
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