RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 P2RY10O00398 339 aa7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 LMX1BO60663 402 aa7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 ZFAND5O76080 213 aa7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 MT-CO2P00403 227 aa7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 IFNA1P01562 189 aa7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF823P16415 610 aa7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 DAP3P51398 398 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 DYNLT3P51808 116 aa7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 BAXQ07812 192 aa7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 TCF23Q7RTU1 214 aa7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 NAT6Q93015 286 aa7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 DPRXA6NFQ7 191 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 MLNRO43193 412 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CGAP01215 116 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 GYPAP02724 150 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CELA2AP08217 269 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 OMGP23515 440 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PTGDSP41222 190 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 MYBPHQ13203 477 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 HIST3H3Q16695 136 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 KCNK17Q96T54 332 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 DEFB126Q9BYW3 111 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 NAA60Q9H7X0 242 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1W2PNR3 127 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 LIPT2A6NK58 231 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 F2Z2F3 143 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CYC1P08574 325 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ZP4Q12836 540 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SP6Q3SY56 376 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 MPV17L2Q567V2 206 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 LCN15Q6UWW0 184 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ASCL4Q6XD76 172 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CENPMQ9NSP4 180 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CRYGCP07315 174 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PIGPP57054 158 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 WDR82Q6UXN9 313 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 RTTNQ86VV8 2226 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF737O75373 536 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 C3orf79P0CE67 100 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SMIM17P0DL12 118 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 TLE1Q04724 770 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PMCHL1Q16048 86 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 BAGE3Q86Y29 109 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 BAGE2Q86Y30 109 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 OR2M3Q8NG83 312 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 R4GMQ9 66 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 NKX2-6A6NCS4 301 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 OR10J4P0C629 311 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CCL4P13236 92 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 RNF138Q8WVD3 245 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 TAAR6Q96RI8 345 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PLEK2Q9NYT0 353 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 VSTM5A8MXK1 200 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CD5LO43866 347 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CST7O76096 145 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 NRASP01111 189 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 KRASP01116 189 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CKS1BP61024 79 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ARFRP1Q13795 201 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CARD17Q5XLA6 110 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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