RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 SPRR3Q9UBC9 169 aa4.96□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 A6NIN4 97 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 CLDN34H7C241 214 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 EFNA2O43921 213 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 ADAM11O75078 769 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 Q0VFX4 171 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 TMEM177Q53S58 311 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 ZNF429Q86V71 674 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 MUC15Q8N387 334 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 OR10S1Q8NGN2 331 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 STARD4Q96DR4 205 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 F8VVB4 439 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 F8VWA3 439 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 HKR1P10072 659 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 SPNP16150 400 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 PSG9Q00887 426 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 NCMAPQ5T1S8 102 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 SMIM12Q96EX1 92 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 SH3BGRL3Q9H299 93 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 FAM90A27PA6NNH2 459 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 TGFBR1P36897 503 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 RELQ04864 619 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 TNFRSF9Q07011 255 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 ZNF154Q13106 437 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 PMS2P11Q13670 270 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 MOGAT2Q3SYC2 334 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 LINC01559Q495D7 138 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 ALKAL2Q6UX46 152 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 OR11H7Q8NGC8 314 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 OR5C1Q8NGR4 320 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 OR2T6Q8NHC8 308 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 SFT2D1Q8WV19 159 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 C18orf12Q96KH6 178 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 HARBI1Q96MB7 349 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 SPACA5Q96QH8 159 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 FLVCR2Q9UPI3 526 aa4.95□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 ZNF205O95201 554 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 IGHV2-70P01814 119 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 SRP14P37108 136 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 EFNB2P52799 333 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 PSG7Q13046 419 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 TEX36Q5VZQ5 186 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 HEPN1Q6WQI6 88 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 MOB3BQ86TA1 216 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 THNSL2Q86YJ6 484 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 TMEM252Q8N6L7 170 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 C5orf66Q9H5L9 145 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 PROK2Q9HC23 129 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 CCL28Q9NRJ3 127 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 DPM3Q9P2X0 92 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 A0A0G2JLM5 398 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 ZFP92A6NM28 416 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 ZNF727A8MUV8 499 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 PPP5D1E7EU14 171 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 GDF9O60383 454 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 C1QCP02747 245 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 CD99P14209 185 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 TMEM241Q24JQ0 296 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 Q6AWC8 147 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 PVRIGQ6DKI7 326 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 PLPPR2Q96GM1 343 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 LOC105371242A0A075B767 164 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 VSIG10L2P0DP72 767 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 ID1P41134 155 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 OPRK1P41145 380 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 FHITP49789 147 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 EFNA4P52798 201 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 HES1Q14469 280 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 PIGYQ3MUY2 71 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 GLCCI1Q86VQ1 547 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 TUBA4BQ9H853 241 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 OR51B2Q9Y5P1 312 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 LY96Q9Y6Y9 160 aa4.94□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 RBFOX3A6NFN3 312 aa4.93□□□□□ -1.62
POLK-215ENST00000514141 J3QR06 171 aa4.93□□□□□ -1.62
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