RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 SSX5O60225 188 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 SMIM18P0DKX4 95 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF260Q3ZCT1 412 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 CDNFQ49AH0 187 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF383Q8NA42 475 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP6V0E1O15342 81 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 AIREO43918 545 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFA3O95167 84 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV1-16P04430 117 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 HACD4Q5VWC8 232 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXL15Q9H469 300 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 WASHC3Q9Y3C0 194 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO7Q9Y3I1 522 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 H7C2Y5 167 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 M0R1X1 148 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 HLA-DRB1P01911 266 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 OR8U9P0C7N5 309 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 PTHLHP12272 177 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 DTYMKP23919 212 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 TALDO1P37837 337 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINB10P48595 397 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 C5orf64Q2M2E5 130 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 Q6ZS49 121 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 C8orf86Q6ZUL3 223 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 NPBQ8NG41 125 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 OR8U1Q8NH10 309 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 PHF21AQ96BD5 680 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 TPSG1Q9NRR2 321 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF221Q9UK13 617 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 ETV7Q9Y603 341 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 G3V318 75 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 PF4P02776 101 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35B1P78383 322 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 DUX3Q96PT4 197 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 PARP11Q9NR21 331 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 IGF1P05019 195 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 TFAP2AP05549 437 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 GNG2P59768 71 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 NCS1P62166 190 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB136Q30KP8 78 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 GINS4Q9BRT9 223 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 OR51J1Q9H342 316 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1456Q9P272 454 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 GAB2Q9UQC2 676 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 WSB1Q9Y6I7 421 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 TGP01266 2768 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-218ENST00000511185 J3QRK9 145 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 RRHO14718 337 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 DIRAS3O95661 229 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLL1P15814 213 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 VDAC1P21796 283 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 SCAND1P57086 179 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.077e-7■■■□□ 17
SH3BP2-218ENST00000511185 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 FUNDC2Q9BWH2 189 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 NUDT19A8MXV4 375 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 FCN1O00602 326 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 SCGNO76038 276 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 FCER2P06734 321 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 CD33P20138 364 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 ARL6IP1Q15041 203 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 ECSCRQ19T08 205 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 TEX38Q6PEX7 206 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00482Q8N8I6 264 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 GHITMQ9H3K2 345 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF580Q9UK33 172 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA2Q9UM82 520 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHG4P01861 327 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 MC5RP33032 325 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXE3Q13461 319 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 PLGLAQ15195 96 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-218ENST00000511185 PSG5Q15238 335 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.4 ms