RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DCTN1-222	ENST00000492717	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DCTN1-222	ENST00000492717	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DCTN1-222	ENST00000492717	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DCTN1-222	ENST00000492717	NF1	P21359	2839 aa		4.65	□□□□□ -1.66
DCTN1-222	ENST00000492717	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.65	□□□□□ -1.66
DCTN1-222	ENST00000492717	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	NDUFS8	O00217	210 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	SIRPB1	O00241	398 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	TIMM23	O14925	209 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	DEGS1	O15121	323 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	LY6G6D	O95868	133 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	TCRB	P04435	133 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	COL8A2	P25067	703 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	HRH1	P35367	487 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	CDKN1A	P38936	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	EFNA4	P52798	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	DLX6	P56179	175 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	TAS2R46	P59540	309 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	BTG1	P62324	171 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	DHODH	Q02127	395 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	PAX2	Q02962	417 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	MEF2D	Q14814	521 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	GRK1	Q15835	563 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	OR56B4	Q8NH76	319 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	RDH5	Q92781	318 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	ODAM	A1E959	279 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	OR5H14	A6NHG9	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717		A8MXK9	166 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	FABP7	O15540	132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	NDUFA2	O43678	99 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	NDUFS7	O75251	213 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	LY6H	O94772	140 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	NDUFB8	O95169	186 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	RAB3D	O95716	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	LYNX1	P0DP58	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	DAO	P14920	347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF44	P15621	663 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC25A16	P16260	332 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	HLA-DMA	P28067	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	GLIPR1	P48060	266 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	CCR6	P51684	374 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	HTD2	P86397	168 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	CDK10	Q15131	360 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67

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