RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491203.5

CNOT4-210, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 4

Gene CNOT4, Length 538 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-210ENST00000491203 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TMEM17Q86X19 198 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 LYG1Q8N1E2 194 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 CCDC32Q9BV29 185 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 DPM3Q9P2X0 92 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 A0A0U1RQK1 487 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 DISC1C4P0D8 188 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 CRLF1O75462 422 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TUSC2O75896 110 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 PPYP01298 95 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 AMY2AP04746 511 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 OR8U9P0C7N5 309 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 IL7P13232 177 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 AADACP22760 399 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 GPR12P47775 334 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 OR8U1Q8NH10 309 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 C17orf50Q8WW18 174 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TOMM40LQ969M1 308 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 RPEQ96AT9 228 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 MALSU1Q96EH3 234 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TSC22D3Q99576 134 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 GHITMQ9H3K2 345 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF221Q9UK13 617 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 RNF150Q9ULK6 438 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 OOSP1A8MZH6 123 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 LY6LH3BQJ8 138 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 HSD17B6O14756 317 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 RAB29O14966 203 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 FBP1P09467 338 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ARHGDIBP52566 201 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 FXYD4P59646 89 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 SSX2Q16385 188 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 OR56B4Q8NH76 319 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 MOB3AQ96BX8 217 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 AJUBAQ96IF1 538 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 CCDC140Q96MF4 163 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 S1PR3Q99500 378 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 SLC6A7Q99884 636 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 AGMATQ9BSE5 352 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 OR2D2Q9H210 308 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 MCUBQ9NWR8 336 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 M0R1X1 148 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TXNL1O43396 289 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 SLC22A5O76082 557 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF735P0CB33 412 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 FAM157CP0CG43 387 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 REG1BP48304 166 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF137PP52743 207 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 KIR3DS1Q14943 382 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 PLA1AQ53H76 456 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms