RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486032.1

COPS3-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene COPS3, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-208ENST00000486032 DISC1C4P0D8 188 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 M0R1X1 148 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 TNFSF12O43508 249 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 TUSC2O75896 110 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 TPPPO94811 219 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 FSHBP01225 129 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 FBP1P09467 338 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 AKAIN1P0CW23 69 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 IGKV1-13P0DP09 117 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 IL7P13232 177 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 NAT1P18440 290 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 CD24P25063 80 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 CD34P28906 385 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 CD40LGP29965 261 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 CEACAM3P40198 252 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 RAB7AP51149 207 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 RAB13P51153 203 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 LUMP51884 338 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 AP3S2P59780 193 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 BAMBIQ13145 260 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 DYRK1AQ13627 763 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 HES1Q14469 280 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 LY6EQ16553 131 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 TMEM30BQ3MIR4 351 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 MIDNQ504T8 468 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 ACTBL2Q562R1 376 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 Q6ZS49 121 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 DYNAPQ8N1N2 210 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 GDPD1Q8N9F7 314 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 ZNF439Q8NDP4 499 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 BEND2Q8NDZ0 799 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 OR4C16Q8NGL9 310 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 OR6F1Q8NGZ6 308 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 CAPSLQ8WWF8 208 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 TRIM63Q969Q1 353 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 TSC22D3Q99576 134 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 SLC5A7Q9GZV3 580 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 LINC00574Q9H8X3 128 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 CCL28Q9NRJ3 127 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 TMEM160Q9NX00 188 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 TAS2R8Q9NYW2 309 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 DPM3Q9P2X0 92 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 ANAPC10Q9UM13 185 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 OR2W1Q9Y3N9 320 aa4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 OR5H14A6NHG9 310 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 H3BUX3 64 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 RAB29O14966 203 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 PEX14O75381 377 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 CRLF1O75462 422 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 PPYP01298 95 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 IGLV1-47P01700 117 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 PI3P19957 117 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 FAUP35544 74 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 LINC00205P59089 165 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 LSAMPQ13449 338 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 HNF4GQ14541 408 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 MEF2DQ14814 521 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 PHLDA2Q53GA4 152 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 OR2B11Q5JQS5 317 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 MINOS1Q5TGZ0 78 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 OVCH2Q7RTZ1 564 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 LINC00311Q8N616 119 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 DRAM1Q8N682 238 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 OR51S1Q8NGJ8 323 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 MALSU1Q96EH3 234 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 GPHA2Q96T91 129 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 S1PR3Q99500 378 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 SSX3Q99909 188 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 FXYD6Q9H0Q3 95 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 IFI27L2Q9H2X8 130 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 HRASLSQ9HDD0 168 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 PIPOXQ9P0Z9 390 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.54□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
COPS3-208ENST00000486032 HIVEP2P31629 2446 aa4.53□□□□□ -1.68
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