RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 UHRF2Q96PU4 802 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 NICN1Q9BSH3 213 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 KCNK15Q9H427 330 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LYRM4Q9HD34 91 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MMP25Q9NPA2 562 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 NRN1Q9NPD7 142 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 FGF21Q9NSA1 209 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TAC3Q9UHF0 121 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 B9D1Q9UPM9 204 aa6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF318Q5VUA4 2279 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PPV9 198 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 A6NDN8 102 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZFP92A6NM28 416 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 C17orf105B2RV13 164 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 K7EQS6 105 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ERI3O43414 337 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CD55P08174 381 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CYC1P08574 325 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CPMP14384 443 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 VDAC1P21796 283 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CCL1P22362 96 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TIMP3P35625 211 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TNFRSF4P43489 277 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 DYNLT3P51808 116 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CCL7P80098 99 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZP4Q12836 540 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 PSMG4Q5JS54 123 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 DCAF12Q5T6F0 453 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZS49 121 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 WDR5BQ86VZ2 330 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF721Q8TF20 911 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 RAB1CQ92928 201 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CLDN23Q96B33 292 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF479Q96JC4 524 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TSSK2Q96PF2 358 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TRIB1Q96RU8 372 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 GPER1Q99527 375 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 APOOQ9BUR5 198 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 RPRMQ9NS64 109 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SPACA6W5XKT8 324 aa6.09□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.09□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 NUMA1Q14980 2115 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GTH9 108 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 PRSS37A4D1T9 235 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 A8MZ25 164 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 NUPR1O60356 82 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 BGLAPP02818 100 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 S100GP29377 79 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 CDKN1AP38936 164 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 OR1D5P58170 312 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 LINC00310P59036 64 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 TBR1Q16650 682 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.08□□□□□ -1.44
PKP4-211ENST00000481115 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.08□□□□□ -1.44
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