RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477375.5

IMP4-215, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, human

TSL 2

Gene IMP4, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IMP4-215	ENST00000477375	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	TXNL1	O43396	289 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	MOS	P00540	346 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	CT45A6	P0DMU7	189 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	CT45A5	P0DMU8	189 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	CT45A7	P0DMV0	189 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	ELK1	P19419	428 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	F2RL1	P55085	397 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	GNG2	P59768	71 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	KIR2DS1	Q14954	304 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375		Q8N9W7	124 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		13.8	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	LINC01548	A6NM66	108 aa		13.79	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	CTDSP2	O14595	271 aa		13.79	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	RAB29	O14966	203 aa		13.79	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	CNTFR	P26992	372 aa		13.79	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		13.79	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		13.79	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		13.79	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.79	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		13.79	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	C5orf30	Q96GV9	206 aa		13.79	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		13.79	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		13.79	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375		M0QZK8	103 aa		13.78	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	FCER2	P06734	321 aa		13.78	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	OR8U9	P0C7N5	309 aa		13.78	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	CD28	P10747	220 aa		13.78	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		13.78	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	LAX1	Q8IWV1	398 aa		13.78	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.78	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		13.78	□□□□□ -0.2
IMP4-215	ENST00000477375	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		13.77	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	FGF16	O43320	207 aa		13.77	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	VWF	P04275	2813 aa		13.77	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	TAS2R20	P59543	309 aa		13.77	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		13.77	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	S1PR3	Q99500	378 aa		13.77	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		13.77	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375		J3QRK9	145 aa		13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	CBX5	P45973	191 aa		13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	GPR12	P47775	334 aa		13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	PRR31	Q5SQ13	230 aa		13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	CNIH2	Q6PI25	160 aa		13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	ZNF383	Q8NA42	475 aa		13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	GINS4	Q9BRT9	223 aa		13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	OR2D2	Q9H210	308 aa		13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	ZNF221	Q9UK13	617 aa		13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375		H0YJW9	148 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	SULT1C2	O00338	296 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	DIRAS3	O95661	229 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	TSPAN15	O95858	294 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	TNFSF8	P32971	234 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	PRSS3	P35030	304 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	ACTB	P60709	375 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		13.75	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	FBN3	Q75N90	2809 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	FABP12	A6NFH5	140 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375		M0R1X1	148 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	PEX14	O75381	377 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	FBXO24	O75426	580 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	IGHG2	P01859	326 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	HLA-DQB1	P01920	261 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	BEST4	Q8NFU0	473 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	SNAPC3	Q92966	411 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	GHITM	Q9H3K2	345 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
IMP4-215	ENST00000477375	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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