RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475319.1

ECHDC1-215, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ECHDC1, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-215ENST00000475319 RER1O15258 196 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 FOXS1O43638 330 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 SYNGR1O43759 233 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC2A10O95528 541 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 MOSP00540 346 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 TTRP02766 147 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 IFNW1P05000 195 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 CELA2AP08217 269 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 CDK2P24941 298 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 SRIP30626 198 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 ADRA1AP35348 466 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 DRD3P35462 400 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 OR1E2P47887 323 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 REG1BP48304 166 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 MTCP1P56278 107 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 CDKN3Q16667 212 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 MPV17L2Q567V2 206 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF684Q5T5D7 378 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM215Q68D42 235 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 TRNP1Q6NT89 227 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF880Q6PDB4 577 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 LCN15Q6UWW0 184 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF621Q6ZSS3 439 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 BCORP1Q8N888 145 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 OR8B12Q8NGG6 310 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 SYNPRQ8TBG9 265 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 TSSK2Q96PF2 358 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 SPIN2AQ99865 258 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 C19orf24Q9BVV8 132 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 PRSS16Q9NQE7 514 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 DHDHQ9UQ10 334 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 MED31Q9Y3C7 131 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa5.06□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 MGAMO43451 1857 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 VWC2LB2RUY7 222 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 H0YIZ8 118 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 HCRTO43612 131 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 FSHBP01225 129 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 APOA2P02652 100 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 CATP04040 527 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 FABP2P12104 132 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF17P17021 662 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 PRTN3P24158 256 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 RPL12P30050 165 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 PRSS3P35030 304 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 HRH1P35367 487 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 KRTDAPP60985 99 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 RPL38P63173 70 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC35B1P78383 322 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 FUT5Q11128 374 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 EDDM3AQ14507 147 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 INSL4Q14641 139 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 MUC21Q5SSG8 566 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 OSR2Q8N2R0 312 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM256Q8N2U0 113 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 C10orf111Q8N326 155 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 TEX29Q8N6K0 151 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF611Q8N823 705 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 OR10D3Q8NH80 312 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 Q8TCH9 128 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNRF4Q8WWF5 429 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 NEUROG1Q92886 237 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 LHX4Q969G2 390 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 C2orf50Q96LR7 162 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 RARRES2Q99969 163 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 CST11Q9H112 138 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 HES4Q9HCC6 221 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 OR5V1Q9UGF6 321 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 PCTPQ9UKL6 214 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 KCNS2Q9ULS6 477 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.05□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa5.04□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 C2CD4BA6NLJ0 364 aa5.04□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF850A8MQ14 1090 aa5.04□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
ECHDC1-215ENST00000475319 MT-CO3P00414 261 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 346.2 ms