RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472598.5

SYP-205, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 3

Gene SYP, Length 761 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-205ENST00000472598 XRCC3O43542 346 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 MOSP00540 346 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 CT45A6P0DMU7 189 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 CT45A5P0DMU8 189 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 CT45A7P0DMV0 189 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 PITPNAQ00169 270 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 SPCS2Q15005 226 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 PHF21AQ96BD5 680 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 C5orf30Q96GV9 206 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 RITA1Q96K30 269 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 DIABLOQ9NR28 239 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 M0QZK8 103 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 F2RL1P55085 397 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 LINC00205P59089 165 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 CD83Q01151 205 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 C10orf99Q6UWK7 81 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 Q8N9W7 124 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 MRAPQ8TCY5 172 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 FGF16O43320 207 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 IGLL1P15814 213 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 RORCP51449 518 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 TAS2R20P59543 309 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 HPGDSO60760 199 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 OR8U9P0C7N5 309 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 CNTFRP26992 372 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 HOGA1Q86XE5 327 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 OR8U1Q8NH10 309 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 S1PR3Q99500 378 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 OR2D2Q9H210 308 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 GHITMQ9H3K2 345 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 MEIS3P1A6NDR6 274 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 LINC01548A6NM66 108 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 H0YJW9 148 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 FCER2P06734 321 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 ELK1P19419 428 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 CD33P20138 364 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 GPR12P47775 334 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 TMEM69Q5SWH9 247 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 CNIH2Q6PI25 160 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 REC114Q7Z4M0 266 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 ZNF383Q8NA42 475 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 BEST4Q8NFU0 473 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 SNAPC3Q92966 411 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 GINS4Q9BRT9 223 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.65□□□□□ -0.06
SYP-205ENST00000472598 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 HLA-DQB1P01920 261 aa14.64□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 APOA1P02647 267 aa14.64□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 PF4V1P10720 104 aa14.64□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 TMBIM6P55061 237 aa14.64□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 ACTBP60709 375 aa14.64□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.64□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 CMTM3Q96MX0 182 aa14.64□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 ZNF221Q9UK13 617 aa14.64□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 ANAPC10Q9UM13 185 aa14.64□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 IGHG2P01859 326 aa14.63□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 MMDQ15546 238 aa14.63□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.63□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.63□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.63□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 GAB2Q9UQC2 676 aa14.63□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.62□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 OR5H14A6NHG9 310 aa14.62□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 J3QRK9 145 aa14.62□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 M0R1X1 148 aa14.62□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 TUSC2O75896 110 aa14.62□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 IGLV2-14P01704 120 aa14.62□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 CTXN2P0C2S0 81 aa14.62□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.62□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.62□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.62□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.62□□□□□ -0.07
SYP-205ENST00000472598 MIXL1Q9H2W2 232 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms