RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 IGKV1D-39P04432 117 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 GRPP07492 148 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 P0C879 139 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 OR13C7P0DN81 318 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 BCL2P10415 239 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SFTPCP11686 197 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 EPHA1P21709 976 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 GLIPR1P48060 266 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 C3AR1Q16581 482 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 TBR1Q16650 682 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 AARDQ4LEZ3 155 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 ZADH2Q8N4Q0 377 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 ZNF709Q8N972 641 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SNX22Q96L94 193 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 AGMATQ9BSE5 352 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 MANBALQ9NQG1 85 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 JPT1Q9UK76 154 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 ACACAQ13085 2346 aa7.15□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 SMCO3A2RU48 225 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OR5H1A6NKK0 313 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 C12orf77C9JDV5 145 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CLDN34H7C241 214 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MGST3O14880 152 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 GPR37O15354 613 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 YPEL1O60688 119 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 HPRT1P00492 218 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 HBZP02008 142 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OPN1MWP04001 364 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OR3A1P47881 315 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 PSMB3P49720 205 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 RAB7AP51149 207 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 SELENOVP59797 346 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 SSX2Q16385 188 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 VWC2Q2TAL6 325 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 FREM1Q5H8C1 2179 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 XP32Q5T750 250 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 WDR82Q6UXN9 313 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZRM9 215 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 BATF2Q8N1L9 274 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 RAB39BQ96DA2 213 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MUCL1Q96DR8 90 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 YPEL2Q96QA6 119 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 C12orf57Q99622 126 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 RARRES2Q99969 163 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 RBKSQ9H477 322 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 RPRMQ9NS64 109 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 A0A0G2JRQ6 117 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 A6NLC8 198 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 LYZL6O75951 148 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 IGHV3-13P01766 116 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 IGHV2-5P01817 119 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 PRDX2P32119 198 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 GABRA2P47869 451 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ASCL1P50553 236 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 RND2P52198 227 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CCL20P78556 96 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 DLK1P80370 383 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 HAGHQ16775 308 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 DNLZQ5SXM8 178 aa7.13□□□□□ -1.27
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