RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM30BQ3MIR4 351 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 MORN2Q502X0 79 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 FAM201AQ5SY85 155 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF695Q8IW36 515 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 OR51H1Q8NH63 302 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 HSPB7Q9UBY9 170 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 RAMP3O60896 148 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 SCGB1D2O95969 90 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 CD5P06127 495 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINE2P07093 398 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 ADCYAP1P18509 176 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 MDKP21741 143 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 ARL16Q0P5N6 197 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 NCR3LG1Q68D85 454 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF596Q8TC21 504 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 MAGT1Q9H0U3 335 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 PARP11Q9NR21 331 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 MMP26Q9NRE1 261 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 GFOD1Q9NXC2 390 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 CALYQ9NYX4 217 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 OR6C3Q9NZP0 311 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 KAAG1Q9UBP8 84 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 PFDN2Q9UHV9 154 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 WSB1Q9Y6I7 421 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 ACACBO00763 2458 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 DOCK11Q5JSL3 2073 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GW64 132 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 DEFB108AA8MXU0 73 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM178BH3BS89 294 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TOR1AO14656 332 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 RAB29O14966 203 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SLC31A2O15432 143 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SPINT2O43291 252 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 HSPA12AO43301 675 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SYNGR2O43760 224 aa4.65□□□□□ -1.67
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