RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	DRAM1	Q8N682	238 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM63	Q969Q1	353 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	JMJD8	Q96S16	334 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	MCUB	Q9NWR8	336 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402		A0A1W2PPI3	338 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	DISC1	C4P0D8	188 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	HILS1	P60008	231 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	HES1	Q14469	280 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF846	Q147U1	533 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ESM1	Q9NQ30	184 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	VGLL3	A8MV65	326 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC22A5	O76082	557 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP5C	P53041	499 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	LINC00205	P59089	165 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	HNF4G	Q14541	408 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	MOB3A	Q96BX8	217 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402		A0A0A6YYJ9	748 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR5H14	A6NHG9	310 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	PROP1	O75360	226 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	VENTX	O95231	258 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM106CP	P0CH98	169 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	CT45A6	P0DMU7	189 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	CT45A5	P0DMU8	189 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	CT45A7	P0DMV0	189 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	IL7	P13232	177 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	AANAT	Q16613	207 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR5R1	Q8NH85	324 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIFO	Q8TCI5	191 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	NABP2	Q9BQ15	211 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHIA	Q9BZP6	476 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	GAB2	Q9UQC2	676 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402		H7C2Y5	167 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	TNFSF12	O43508	249 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGKV1D-33	P01593	117 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGKV1-33	P01594	117 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	PGAM2	P15259	253 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	CD40LG	P29965	261 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	DYNLT3	P51808	116 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	TERB2	Q8NHR7	220 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	CFHR4	Q92496	578 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	C5orf30	Q96GV9	206 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPHA2	Q96T91	129 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC32	Q9BV29	185 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		11	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGLV2-14	P01704	120 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF735	P0CB33	412 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	CD1B	P29016	333 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	GNRHR	P30968	328 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	LSAMP	Q13449	338 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM86B	Q8N661	226 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRRT1	Q99946	306 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	TCF19	Q9Y242	345 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	CENPX	A8MT69	81 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM77	I1YAP6	450 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	APOA2	P02652	100 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM11	P17152	192 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	THBS3	P49746	956 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	C16orf87	Q6PH81	154 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SELENBP1-208	ENST00000447402	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		10.99	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms