RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 G3V318 75 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 H0YJW9 148 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 IGLV1-40P01703 118 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 APOA2P02652 100 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 SCTP09683 121 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM50BP56557 158 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 ECSCRQ19T08 205 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 HES5Q5TA89 166 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 AGMATQ9BSE5 352 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 CENPOQ9BU64 300 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 FBXL15Q9H469 300 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 RAB26Q9ULW5 256 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 RAB9AP51151 201 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF616Q08AN1 781 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF491Q8N8L2 437 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 A0A1W2PN81 502 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 TFAP2AP05549 437 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 CHRNA7P36544 502 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 INSL3P51460 131 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 CX3CL1P78423 397 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 RUNX1Q01196 453 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 CBX3Q13185 183 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 FHL3Q13643 280 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 KLK15Q9H2R5 256 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 RDH8Q9NYR8 311 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 A3GALT2U3KPV4 340 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 IFITM5A6NNB3 132 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 LDLRAD4O15165 306 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 FABP7O15540 132 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 SPDEFO95238 335 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 RAB3BP20337 219 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 GALP22466 123 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 TALDO1P37837 337 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 ARL6IP1Q15041 203 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF260Q3ZCT1 412 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 PLAC9Q5JTB6 97 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 PDPNQ86YL7 162 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 OR10R2Q8NGX6 335 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 OR5B12Q96R08 314 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 B9D2Q9BPU9 175 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 Q9H521 79 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC78-204ENST00000439619 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 BET1O15155 118 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 DIRAS3O95661 229 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 RAB6AP20340 208 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ECI1P42126 302 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 GABARAPL2P60520 117 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 SSX1Q16384 188 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 GNB4Q9HAV0 340 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 I3L521 148 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 M0R1X1 148 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ARFRP1Q13795 201 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 PSG5Q15238 335 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 AKIRIN2Q53H80 203 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 ACTBL2Q562R1 376 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 CLCC1Q96S66 551 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 GINS4Q9BRT9 223 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 A0A075B6Q4 140 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 FCGR3AP08637 254 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 LINC01619G3V211 115 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 FCN1O00602 326 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 CNIH1O95406 144 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-204ENST00000439619 CA2P00918 260 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms