RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430445.1

RAB17-208, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, human

TSL 5

Gene RAB17, Length 421 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB17-208	ENST00000430445	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RAB17-208	ENST00000430445		H3BUA1	57 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RAB17-208	ENST00000430445	SLC22A1	O15245	554 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RAB17-208	ENST00000430445	CSN3	P07498	182 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RAB17-208	ENST00000430445	DCK	P27707	260 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RAB17-208	ENST00000430445	FXYD3	Q14802	87 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RAB17-208	ENST00000430445	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RAB17-208	ENST00000430445	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RAB17-208	ENST00000430445		Q8N402	240 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RAB17-208	ENST00000430445	OR5T1	Q8NG75	326 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RAB17-208	ENST00000430445	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RAB17-208	ENST00000430445	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RAB17-208	ENST00000430445	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RAB17-208	ENST00000430445	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RAB17-208	ENST00000430445	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RAB17-208	ENST00000430445	CIB2	O75838	187 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	SPDEF	O95238	335 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	CAPG	P40121	348 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	SVOP	Q8N4V2	548 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445		H3BNX3	289 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	TRBV12-3	P01733	135 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	IGKV1-16	P04430	117 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	CPE	P16870	476 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	DEFA5	Q01523	94 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	TATDN3	Q17R31	274 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	KMT2A	Q03164	3969 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	ITGB1BP1	O14713	200 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	SLC25A17	O43808	307 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	PROP1	O75360	226 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	NAPSA	O96009	420 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	MYL12A	P19105	171 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	AADAC	P22760	399 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	LINC00205	P59089	165 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	CD81	P60033	236 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	SETD6	Q8TBK2	473 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	SLC29A1	Q99808	456 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	GHRL	Q9UBU3	117 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	TPPP	O94811	219 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	CNIH1	O95406	144 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	BRI3	O95415	125 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	DYRK1A	Q13627	763 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	RPEL1	Q2QD12	228 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	RNLS	Q5VYX0	342 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	OR10K2	Q6IF99	312 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	PDPN	Q86YL7	162 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF383	Q8NA42	475 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	BVES	Q8NE79	360 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	DERL3	Q96Q80	235 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	NEURL2	Q9BR09	285 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	IRGM	A1A4Y4	181 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	OR2A4	O95047	310 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	HTR2C	P28335	458 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	CEACAM6	P40199	344 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	DEFB125	Q8N687	156 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	TMEM68	Q96MH6	324 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	PEMT	Q9UBM1	199 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	APOA2	P02652	100 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	CD7	P09564	240 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	UBB	P0CG47	229 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	ZBTB25	P24278	435 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	LGALS7	P47929	136 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RAB17-208	ENST00000430445	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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