RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 NICN1Q9BSH3 213 aa14.83□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.83□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 RBBP9O75884 186 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 TFAP2AP05549 437 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 UBBP0CG47 229 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 HTR2CP28335 458 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 CEACAM6P40199 344 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 INSL4Q14641 139 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 Q8N1Y9 231 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF485Q8NCK3 441 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 SETD9Q8NE22 299 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 OR5T1Q8NG75 326 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 TMED9Q9BVK6 235 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.82□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.81□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 SLC22A1O15245 554 aa14.81□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 CNIH1O95406 144 aa14.81□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 IGLV1-51P01701 117 aa14.81□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 DEFA5Q01523 94 aa14.81□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 FXYD3Q14802 87 aa14.81□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 GLT8D1Q68CQ7 371 aa14.81□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.81□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 SPATA25Q9BR10 227 aa14.81□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 TUBA4BQ9H853 241 aa14.81□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 SLC25A17O43808 307 aa14.8□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 ZP3P21754 424 aa14.8□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 WNT4P56705 351 aa14.8□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 TTC23Q5W5X9 447 aa14.8□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 AHSA2Q719I0 299 aa14.8□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.8□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 POC5Q8NA72 575 aa14.8□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.8□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.8□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 THRSPQ92748 146 aa14.8□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 EDA2RQ9HAV5 297 aa14.8□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.8□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF221Q9UK13 617 aa14.8□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 APOA2P02652 100 aa14.79□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 IGKV1-16P04430 117 aa14.79□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 IFNA6P05013 189 aa14.79□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB25P24278 435 aa14.79□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 LINC00205P59089 165 aa14.79□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 HLA-DRB3P79483 266 aa14.79□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.79□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 RNF5Q99942 180 aa14.79□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 AK3Q9UIJ7 227 aa14.79□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 NAPSAO96009 420 aa14.78□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 SYNJ2BPP57105 145 aa14.78□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.78□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 GTSCR1Q86UQ5 136 aa14.78□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.78□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.78□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 A0A0G2JLM5 398 aa14.77□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 H0Y980 276 aa14.77□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 M0R1X1 148 aa14.77□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 UNC119Q13432 240 aa14.77□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 HAGHQ16775 308 aa14.77□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.77□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.77□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF383Q8NA42 475 aa14.77□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.77□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 AGMATQ9BSE5 352 aa14.77□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 COA4Q9NYJ1 87 aa14.77□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 CSMD3Q7Z407 3707 aa14.77□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 A0A0A6YYD4 124 aa14.76□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 SOCS1O15524 211 aa14.76□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 SPDEFO95238 335 aa14.76□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 SCTP09683 121 aa14.76□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 APELAP0DMC3 54 aa14.76□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 P2RY14Q15391 338 aa14.76□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.76□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 PDPNQ86YL7 162 aa14.76□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 PHB2Q99623 299 aa14.76□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 TM2D1Q9BX74 207 aa14.76□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 RETNQ9HD89 108 aa14.76□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.76□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.76□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 A8MZ25 164 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 CD1AP06126 327 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 LGALS7P47929 136 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 HSD17B12Q53GQ0 312 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 H3BUA1 57 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 ITGB1BP1O14713 200 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 VEGFCP49767 419 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 TATDN3Q17R31 274 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN4-202ENST00000415164 RPEL1Q2QD12 228 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms