RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 CGAP01215 116 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 CD8AP01732 235 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTDAPP60985 99 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL38P63173 70 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 TBR1Q16650 682 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 SFXN4Q6P4A7 337 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 CBLL1Q75N03 491 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 SPEM1Q8N4L4 309 aa5.77□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.77□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 PRO0628Q9UI54 55 aa5.77□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 PARP11Q9NR21 331 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa5.76□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.76□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 ZMAT4Q9H898 229 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 MOB1AQ9H8S9 216 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 POLR1DQ9Y2S0 133 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 ARID1AO14497 2285 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 TM2D1Q9BX74 207 aa5.76□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.75□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa5.75□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 MALP21145 153 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 MEOX1P50221 254 aa5.75□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 TCEAL5Q5H9L2 206 aa5.75□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 RPL15P61313 204 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1CAP62136 330 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 TAL2Q16559 108 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF439Q8NDP4 499 aa5.75□□□□□ -1.49
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