RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 SAXO1Q8IYX7 474 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 PRSS35Q8N3Z0 413 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR5D14Q8NGL3 314 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR2G2Q8NGZ5 317 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CORO2AQ92828 525 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MYDGFQ969H8 173 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 FGGYQ96C11 551 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CYYR1Q96J86 154 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OPALINQ96PE5 141 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CHST6Q9GZX3 395 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 HMG20AQ9NP66 347 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 IMPAD1Q9NX62 359 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 HHLA2Q9UM44 414 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 AP4S1Q9Y587 144 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ORC6Q9Y5N6 252 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TENM2Q9NT68 2774 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 DAPL1A0PJW8 107 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 PSMB11A5LHX3 300 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SERPINE3A8MV23 424 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 M0R129 80 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MAGEB3O15480 346 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MITFO75030 526 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ENTPD6O75354 484 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ATP5HO75947 161 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR2H2O95918 312 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 IGLV1-47P01700 117 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ISG15P05161 165 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CSN2P05814 226 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 DBTP11182 482 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CD24P25063 80 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 NFYBP25208 207 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 KIR3DL2P43630 455 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR3A1P47881 315 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR3A4PP47883 348 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 KCNJ3P48549 501 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 RAB7AP51149 207 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CCR9P51686 369 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SNU13P55769 128 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 AESQ08117 197 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MADCAM1Q13477 382 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 HES1Q14469 280 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MOGAT2Q3SYC2 334 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TP53I3Q53FA7 332 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 KRBOX4Q5JUW0 171 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MEDAGQ5VYS4 303 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SSX6Q7RTT6 188 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SERPINA12Q8IW75 414 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 RDH10Q8IZV5 341 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OSR2Q8N2R0 312 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 COMMD1Q8N668 190 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ACBD7Q8N6N7 88 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR13C3Q8NGS6 347 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR9G1Q8NH87 305 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TOMM40LQ969M1 308 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 RPEQ96AT9 228 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MBOAT4Q96T53 435 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 GPER1Q99527 375 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CIB1Q99828 191 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 GON7Q9BXV9 100 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 COMMD4Q9H0A8 199 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 RIBC2Q9H4K1 309 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 GNB4Q9HAV0 340 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 INPP5EQ9NRR6 644 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 PRO0461Q9UI25 63 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MEIKINA0A087WXM9 373 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 A0A087X0M5 115 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 A0A1B0GX30 115 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM212A6NML5 194 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 LY6LH3BQJ8 138 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 J3QLW9 94 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 K7EIL1 84 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 FGF16O43320 207 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 CIB2O75838 187 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 MMP23AO75900 390 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 CD2P06729 351 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 HCKP08631 526 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 CALCBP10092 127 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF19P17023 458 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM11P17152 192 aa3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms