RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 PROP1O75360 226 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 PRRX1P54821 245 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 SRPXP78539 464 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 RPL39P5Q59GN2 51 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 LIN54Q6MZP7 749 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 LIAT1Q6ZQX7 453 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 OR10X1Q8NGY0 326 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 C1orf159Q96HA4 380 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 S1PR3Q99500 378 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 SIRPDQ9H106 197 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 MGAT4CQ9UBM8 478 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 CSMD2Q7Z408 3487 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 UCP1P25874 307 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 LRTM2Q8N967 370 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 BEND2Q8NDZ0 799 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF251Q9BRH9 671 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 LPAR2Q9HBW0 351 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 SIRT7Q9NRC8 400 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 PRR13Q9NZ81 148 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 ZNRD1Q9P1U0 126 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 INSIG2Q9Y5U4 225 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 M0R1X1 148 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 CCNKO75909 580 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 IGLV1-47P01700 117 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 CXCL3P19876 107 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF137PP52743 207 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 DLX1P56177 255 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 LGI3Q8N145 548 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 B4DSR2 109 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 MSMBP08118 114 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 HLA-GP17693 338 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 COX7A1P24310 79 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 IL3RAP26951 378 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 DUTP33316 252 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 RPL30P62888 115 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 HLA-DRB5Q30154 266 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 FAM71F2Q6NXP2 309 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 VMO1Q7Z5L0 202 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 OR11H6Q8NGC7 330 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM186Q96B77 213 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM56Q96MV1 263 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 REG4Q9BYZ8 158 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 ITPR2Q14571 2701 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 LINC00473A8K010 186 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 GOSR2O14653 212 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 MMP9P14780 707 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 C2orf68Q2NKX9 166 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 PNKDQ8N490 385 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 ADTRPQ96IZ2 230 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 Q96MF0 132 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 RAB18Q9NP72 206 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 RNF223E7ERA6 249 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 TOX4O94842 621 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 CDS2O95674 445 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 SERPINE2P07093 398 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 CD83Q01151 205 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 NCR3LG1Q68D85 454 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 OR5M8Q8NGP6 311 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 IL22RA2Q969J5 263 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 ST6GAL2Q96JF0 529 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 THBS3P49746 956 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 PAX8Q06710 450 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 HCP5Q6MZN7 132 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 LHFPL5Q8TAF8 219 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 FOXC2Q99958 501 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 PDZD2O15018 2839 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.164e-7■■□□□ 12.3
CCDC71-201ENST00000321895 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CCDC71-201ENST00000321895 A8MV72 311 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 RPA2P15927 270 aa16.02■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM268Q5VZI3 342 aa16.02■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF695Q8IW36 515 aa16.02■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 OR4P4Q8NGL7 312 aa16.02■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 CD300LFQ8TDQ1 290 aa16.02■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 C18orf12Q96KH6 178 aa16.02■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 PCGF1Q9BSM1 259 aa16.02■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 TRAV20A0A0B4J274 112 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms