RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 PRR18Q8N4B5 295 aa13.23□□□□□ -0.29
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TSNARE1-201ENST00000307180 PERPQ96FX8 193 aa13.18□□□□□ -0.3
TSNARE1-201ENST00000307180 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM231Q9H6L2 316 aa13.18□□□□□ -0.3
TSNARE1-201ENST00000307180 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
TSNARE1-201ENST00000307180 DMRT1Q9Y5R6 373 aa13.18□□□□□ -0.3
TSNARE1-201ENST00000307180 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa13.18□□□□□ -0.3
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TSNARE1-201ENST00000307180 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
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