RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00862A6NCI5 91 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNAB3O43448 404 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFB3O43676 98 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFA2O43678 99 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFS7O75251 213 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV1-39P01597 117 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV1D-39P04432 117 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 CDKN1AP38936 164 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB32Q13637 225 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 AVPI1Q5T686 147 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF841Q6ZN19 808 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 COMMD9Q9P000 198 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 MBD2Q9UBB5 411 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 MLXQ9UH92 298 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 hADV38S2A0JD32 116 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00587B1AMM8 73 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ATG12O94817 140 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 IFNA21P01568 189 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 DAOP14920 347 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 CCL3L1P16619 93 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF546Q86UE3 836 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF222A6NCQ9 220 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 RPA2P15927 270 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 SRPXP78539 464 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 NMSQ5H8A3 153 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF695Q8IW36 515 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5AC2Q9NZP5 309 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 VPS13CQ709C8 3753 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0G2JRQ6 117 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM74A7A6NL05 159 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 S100GP29377 79 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 MSMO1Q15800 293 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 NANPQ8TBE9 248 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PPE3 182 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00473A8K010 186 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 RAMP3O60896 148 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 LYL1P12980 280 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 IL22RA2Q969J5 263 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 MFFQ9GZY8 342 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 L7N2F9 121 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 NFYBP25208 207 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 DLX6P56179 175 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 Q3ZCU0 254 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 THAP6Q8TBB0 222 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ITGB1BP1O14713 200 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 VDAC1P21796 283 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 TMUB2Q71RG4 321 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF714Q96N38 554 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPINE2P07093 398 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 RRASP10301 218 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 OPCMLQ14982 345 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 OR1S1Q8NH92 325 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115 ms