RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa17.99■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 ULBP2Q9BZM5 246 aa17.99■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 M0QZ24 198 aa17.98■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 IGHEP01854 428 aa17.98■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 IGHV4-34P06331 123 aa17.98■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 C20orf204Q6ZNR8 217 aa17.98■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 SPOCK3Q9BQ16 436 aa17.98■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 OR2W1Q9Y3N9 320 aa17.98■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 BRWD1Q9NSI6 2320 aa17.98■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 FCN1O00602 326 aa17.98■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 PDE6DO43924 150 aa17.98■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 KRTCAP3Q53RY4 240 aa17.98■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 FAM69BQ5VUD6 431 aa17.98■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 TMEM92Q6UXU6 159 aa17.98■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 KMT5CQ86Y97 462 aa17.98■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 CTXN2P0C2S0 81 aa17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 FASLGP48023 281 aa17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 SAXO1Q8IYX7 474 aa17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 OR4C5Q8NGB2 326 aa17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 OR1L1Q8NH94 360 aa17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 UCN2Q96RP3 112 aa17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 NRN1Q9NPD7 142 aa17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 CFAP54Q96N23 3096 aa17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 CBY3A6NI87 242 aa17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 CARD18P57730 90 aa17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 OR1F12Q8NHA8 337 aa17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 KLHDC7BQ96G42 594 aa17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 WNT10AQ9GZT5 417 aa17.97■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 SLC17A3O00476 420 aa17.96■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 TIMP3P35625 211 aa17.96■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 IER3P46695 156 aa17.96■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 FBLN7Q53RD9 439 aa17.96■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 OR10G8Q8NGN5 311 aa17.96■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 TMEM204Q9BSN7 226 aa17.96■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 STRADBQ9C0K7 418 aa17.96■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 GNB4Q9HAV0 340 aa17.96■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 NPIPA2E9PIF3 369 aa17.96■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 NPIPA3F8WFD2 350 aa17.96■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 AMTP48728 403 aa17.96■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 Q0VG73 95 aa17.96■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 RDH5Q92781 318 aa17.96■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 NPCDR1Q9BY65 106 aa17.96■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
ODC1-201ENST00000234111 A8MXE2 369 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 SNURFLB1AK76 121 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 SERPINA7P05543 415 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 PMCHP20382 165 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 ARL4DP49703 201 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 FAM27BQ5VT28 67 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 MRGPRDQ8TDS7 321 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 IL1F10Q8WWZ1 152 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 CLDN23Q96B33 292 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 TMEM147Q9BVK8 224 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 ZNF585BQ52M93 769 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 IGFLR1Q9H665 355 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 RNF24Q9Y225 148 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 IGLV2-14P01704 120 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 GCSAMLQ5JQS6 135 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 ATOH7Q8N100 152 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 RNF138Q8WVD3 245 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 OR1A1Q9P1Q5 309 aa17.95■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 A0A1W2PN81 502 aa17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 EPOPA6NHQ4 379 aa17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 GDF9O60383 454 aa17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 ZNF253O75346 499 aa17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 TSPOP30536 169 aa17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 HLA-DRB5Q30154 266 aa17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 MAJINQ3KP22 176 aa17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 CCDC74BQ96LY2 380 aa17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 UNC13CQ8NB66 2214 aa17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 LILRA5A6NI73 299 aa17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 ZNF32P17041 273 aa17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 CLDN15P56746 228 aa17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 OCC1Q8TAD7 63 aa17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 KCNIP2Q9NS61 270 aa17.94■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 TNFSF11O14788 317 aa17.93■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 PPBPP02775 128 aa17.93■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 S100A7P31151 101 aa17.93■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 LMX1AQ8TE12 382 aa17.93■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 KCNE4Q8WWG9 221 aa17.93■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 RCHY1Q96PM5 261 aa17.93■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 BET1LQ9NYM9 111 aa17.93■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 CLN8Q9UBY8 286 aa17.93■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 MMP23AO75900 390 aa17.93■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 HLA-BQ31612 363 aa17.93■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 MORN2Q502X0 79 aa17.93■□□□□ 0.46
ODC1-201ENST00000234111 TRIM61Q5EBN2 209 aa17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms