RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 GSX2Q9BZM3 304 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 IFI27L2Q9H2X8 130 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PPH5 198 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 C22orf46C9J442 243 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFS8O00217 210 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 GIPP09681 153 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB7AP51149 207 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP10-9P60411 292 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 Q3ZCU0 254 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 ESCO2Q56NI9 601 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 LIAT1Q6ZQX7 453 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 LRTM2Q8N967 370 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf105Q8TEF2 133 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM168AQ92567 244 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM222Q9H0R3 208 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB18Q9NP72 206 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 SDHAF2Q9NX18 166 aa20.43■□□□□ 0.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 CCSO14618 274 aa20.42■□□□□ 0.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 MARVELD3Q96A59 401 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB39BQ96DA2 213 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 PERPQ96FX8 193 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 PIMREGQ9BSJ6 248 aa20.42■□□□□ 0.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 GAB2Q9UQC2 676 aa20.42■□□□□ 0.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV1-8P0DP01 117 aa20.41■□□□□ 0.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 LOC105371242A0A075B767 164 aa20.4■□□□□ 0.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PPE3 182 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 VWC2LB2RUY7 222 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAP1O75689 374 aa20.4■□□□□ 0.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 UCP1P25874 307 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR12P47775 334 aa20.4■□□□□ 0.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 OR51H1Q8NH63 302 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 ASB13Q8WXK3 278 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa20.4■□□□□ 0.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 PROP1O75360 226 aa20.39■□□□□ 0.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 ODF3L1Q8IXM7 274 aa20.38■□□□□ 0.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 A8MXK9 166 aa20.37■□□□□ 0.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF66Q6ZN08 573 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 C8orf31Q8N9H6 132 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM133Q9H2Q1 129 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa20.36■□□□□ 0.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 G3V3Q6 166 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB29O14966 203 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 CATR1Q13166 79 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 LYZL2Q7Z4W2 148 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00311Q8N616 119 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF251Q9BRH9 671 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 C5orf51A6NDU8 294 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 MPTX1A8MV57 137 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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