RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR56B4Q8NH76 319 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 SLC6A7Q99884 636 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR2D2Q9H210 308 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.92□□□□□ -1.3
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SGMS1-211ENST00000626236 NUP50Q9UKX7 468 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 RNF150Q9ULK6 438 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
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SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.91□□□□□ -1.3
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SGMS1-211ENST00000626236 ITGB1BP1O14713 200 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TUSC2O75896 110 aa6.91□□□□□ -1.3
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SGMS1-211ENST00000626236 OR8U9P0C7N5 309 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.91□□□□□ -1.3
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SGMS1-211ENST00000626236 IL3RAP26951 378 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 HTR1DP28221 377 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 GPR12P47775 334 aa6.91□□□□□ -1.3
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SGMS1-211ENST00000626236 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 MIDNQ504T8 468 aa6.91□□□□□ -1.3
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SGMS1-211ENST00000626236 C16orf87Q6PH81 154 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.91□□□□□ -1.3
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SGMS1-211ENST00000626236 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.91□□□□□ -1.3
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SGMS1-211ENST00000626236 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TOMM40LQ969M1 308 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 BEX2Q9BXY8 128 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 MAST4O15021 2626 aa6.91□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0U1RQK1 487 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR5H14A6NHG9 310 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CENPXA8MT69 81 aa6.9□□□□□ -1.3
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SGMS1-211ENST00000626236 ZNF735P0CB33 412 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CD33P20138 364 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 PAX6P26367 422 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CEACAM3P40198 252 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 REG1BP48304 166 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 IFITM3Q01628 133 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 C17orf50Q8WW18 174 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 BORCS5Q969J3 196 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 RPEQ96AT9 228 aa6.9□□□□□ -1.3
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SGMS1-211ENST00000626236 PRRT1Q99946 306 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 AGMATQ9BSE5 352 aa6.9□□□□□ -1.3
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SGMS1-211ENST00000626236 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.9□□□□□ -1.3
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SGMS1-211ENST00000626236 ZNF221Q9UK13 617 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 LY6LH3BQJ8 138 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 PLA2G10O15496 165 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 LYRM1O43325 122 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 PGAM2P15259 253 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 SRD5A1P18405 259 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 BPIFB3P59826 476 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 TNP2Q05952 138 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 BAMBIQ13145 260 aa6.89□□□□□ -1.31
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