RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602511.1

KDM5B-210, Transcript of lysine demethylase 5B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM5B, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5B-210ENST00000602511 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.71□□□□□ -1.33
KDM5B-210ENST00000602511 A0A0B4J2A0 478 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 RNF212BA8MTL3 300 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 OR4E1P0C645 316 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 ANXA3P12429 323 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 CCL3L1P16619 93 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 GNRHRP30968 328 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF137PP52743 207 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 FXYD4P59646 89 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 GNMTQ14749 295 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 Q5PR19 223 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF626Q68DY1 528 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 TREML4Q6UXN2 200 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 OR9G1Q8NH87 305 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 TOMM40LQ969M1 308 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 AGMATQ9BSE5 352 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.71□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 VPS13CQ709C8 3753 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 A0A0B4J293 547 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 B4DSR2 109 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 RAB29O14966 203 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 IGLV2-14P01704 120 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 PRTN3P24158 256 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 PIGPP57054 158 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 SRPXP78539 464 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 CATR1Q13166 79 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 DHRS2Q13268 280 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 LYG2Q86SG7 212 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 DRAM1Q8N682 238 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 RFESDQ8TAC1 157 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 ASB13Q8WXK3 278 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 TMEM230Q96A57 120 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 SIRPDQ9H106 197 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 OR2D2Q9H210 308 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 NAA60Q9H7X0 242 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF221Q9UK13 617 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 ALG5Q9Y673 324 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 A0A0A6YYJ9 748 aa6.69□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.69□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.69□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.69□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 C9orf170A2RU37 121 aa6.69□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 H0Y980 276 aa6.69□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 J3QLI3 93 aa6.69□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 J3QR06 171 aa6.69□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 MPPED1O15442 326 aa6.69□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 TXNL1O43396 289 aa6.69□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 SFT2D2O95562 160 aa6.69□□□□□ -1.34
KDM5B-210ENST00000602511 IFNA2P01563 188 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms