RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 FCN1O00602 326 aa19.73■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 PITPNAQ00169 270 aa19.73■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH26Q8IXH8 852 aa19.73■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF485Q8NCK3 441 aa19.73■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2AK2Q8NG84 335 aa19.73■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 GALMQ96C23 342 aa19.73■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa19.73■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAH1Q9P2D7 4330 aa19.72■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 RRHO14718 337 aa19.72■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 ST8SIA5O15466 376 aa19.72■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS11O94810 467 aa19.72■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa19.72■□□□□ 0.75
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CAPNS1-211ENST00000590874 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa19.72■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
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CAPNS1-211ENST00000590874 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa19.71■□□□□ 0.75
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CAPNS1-211ENST00000590874 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 Q8N1Y9 231 aa19.71■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD5Q8WTS1 349 aa19.71■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 NRG4Q8WWG1 115 aa19.71■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 DERL3Q96Q80 235 aa19.71■□□□□ 0.75
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4C12Q96R67 309 aa19.71■□□□□ 0.75
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CAPNS1-211ENST00000590874 CT45A5P0DMU8 189 aa19.7■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 CT45A7P0DMV0 189 aa19.7■□□□□ 0.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa19.7■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 MS4A10Q96PG2 267 aa19.7■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 LDLRAD4O15165 306 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 DOC2BQ14184 412 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 PYHIN1Q6K0P9 492 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R27Q86WC6 154 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF555Q8NEP9 628 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 IL1F10Q8WWZ1 152 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM80Q96HE8 168 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 LYSTQ99698 3801 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 VCXQ9H320 206 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 PIPOXQ9P0Z9 390 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 H0YJW9 148 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 TPPP2P59282 170 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTBL2Q562R1 376 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa19.68■□□□□ 0.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 RHOVQ96L33 236 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 C19orf73Q9NVV2 129 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 STEAP1Q9UHE8 339 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC42Q9Y546 428 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5H14A6NHG9 310 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB29O14966 203 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ISOC1Q96CN7 298 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 CLCC1Q96S66 551 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 UQCC2Q9BRT2 126 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 FAAP24Q9BTP7 215 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ABRACLQ9P1F3 81 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC23A1Q9UHI7 598 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF150Q9ULK6 438 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPA12AO43301 675 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV1-51P01701 117 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 AKIRIN2Q53H80 203 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10K2Q6IF99 312 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf201Q7Z4U5 140 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 SVOPQ8N4V2 548 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 PACRGLQ8N7B6 248 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 LFNGQ8NES3 379 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD14BQ96IU4 210 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 NEDD4LQ96PU5 975 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 RSRP1Q9BUV0 290 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 GHRLQ9UBU3 117 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 STUB1Q9UNE7 303 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 WASHC3Q9Y3C0 194 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 CSMD3Q7Z407 3707 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 A8MZ25 164 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 H7C2Y5 167 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 MED21Q13503 144 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5AN1Q8NGI8 311 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ELOVL1Q9BW60 279 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-211ENST00000590874 CA2P00918 260 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 MC5RP33032 325 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R43P59537 309 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 GGHQ92820 318 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SLA2Q9H6Q3 261 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
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