RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, human

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-208	ENST00000589162	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		Q6ZS49	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR2D2	Q9H210	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	PDZD2	O15018	2839 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		A0A1B0GVG6	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		B4DSR2	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		J3QR06	171 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	YPEL1	O60688	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TUSC2	O75896	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	RLN1	P04808	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ARG1	P05089	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZBTB25	P24278	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CD24	P25063	80 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	LINC00310	P59036	64 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	AP3S2	P59780	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	HTD2	P86397	168 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SP6	Q3SY56	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ACTBL2	Q562R1	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ENKUR	Q8TC29	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TMEM230	Q96A57	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	YPEL2	Q96QA6	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	JPT1	Q9UK76	154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	POLQ	O75417	2590 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		A0A0B4J293	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		M0R1W7	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		M0R1X1	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TOR1A	O14656	332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	NDUFB6	O95139	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	DIRAS3	O95661	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TCRB	P04435	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CTXN2	P0C2S0	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	RPA2	P15927	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	AKR1C4	P17516	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	PRTN3	P24158	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	GNRHR	P30968	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	GPR12	P47775	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	GZMK	P49863	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	DEFA1	P59665	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	DEFA3	P59666	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	MEF2D	Q14814	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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