RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 FCN2Q15485 313 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC12BQ2HXU8 276 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR3DL3Q8N743 410 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 CASTOR1Q8WTX7 329 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 TACC2O95359 2948 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-206ENST00000588815 CELSR2Q9HCU4 2923 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ST8SIA5O15466 376 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 PIPOXQ9P0Z9 390 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNKO75909 580 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR12P47775 334 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF134P52741 427 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 SRPXP78539 464 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC9A3R2Q15599 337 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CT45A1Q5HYN5 189 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00311Q8N616 119 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CT45A3Q8NHU0 189 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF596Q8TC21 504 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 IFI27L2Q9H2X8 130 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF150Q9ULK6 438 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 FBN2P35556 2912 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-GP17693 338 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 F2RP25116 425 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ERVFRD-1P60508 538 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF66Q6ZN08 573 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFRSF14Q92956 283 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM133Q9H2Q1 129 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 DBX1A6NMT0 343 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 H0Y980 276 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB29O14966 203 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5AC1P0C628 307 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 OR11H7Q8NGC8 314 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ABHD14BQ96IU4 210 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 SDHAF2Q9NX18 166 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CENPEQ02224 2701 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CATR1Q13166 79 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM187Q14656 261 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 LRTM2Q8N967 370 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 UXS1Q8NBZ7 420 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 OR9G1Q8NH87 305 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ONECUT1Q9UBC0 465 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 MGAT4CQ9UBM8 478 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 PAX2Q02962 417 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 GLYATL2Q8WU03 294 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ASB13Q8WXK3 278 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 LEAP2Q969E1 77 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM222Q9H0R3 208 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 KPTNQ9Y664 436 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC31A2O15432 143 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD55Q3KP44 614 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS57Q6UWY2 283 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 LIAT1Q6ZQX7 453 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 WNK2Q9Y3S1 2297 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFSF12O43508 249 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 UCP1P25874 307 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 GNG10P50151 68 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 LIN54Q6MZP7 749 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 LGI3Q8N145 548 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 TP53RKQ96S44 253 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB18Q9NP72 206 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 J3QR06 171 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-7P01780 117 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CXCL3P19876 107 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ABHD12Q8N2K0 398 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ST6GAL2Q96JF0 529 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 USF1P22415 310 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 LCN2P80188 198 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 UTF1Q5T230 341 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM71F2Q6NXP2 309 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 LYG1Q8N1E2 194 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 IL22RA2Q969J5 263 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 C5orf30Q96GV9 206 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM56Q96MV1 263 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 S1PR3Q99500 378 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCA12Q86UK0 2595 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 PRTN3P24158 256 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 PRRX1P54821 245 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ARF6P62330 175 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CD83Q01151 205 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 SP6Q3SY56 376 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ODF3L1Q8IXM7 274 aa25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms