RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 COL10A1Q03692 680 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 GAGE1Q13065 139 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB31Q13636 194 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 SSPNQ14714 243 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 TESK1Q15569 626 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF726P1Q15940 193 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF124Q15973 351 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 PRR7Q8TB68 274 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 RELTQ969Z4 430 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 GALMQ96C23 342 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.55□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 C5orf49A4QMS7 147 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 C9JCJ5 164 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 C11orf94C9JXX5 98 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 IFNL4K9M1U5 179 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 TNFSF15O95150 251 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 CER1O95813 267 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 CXorf1O96002 111 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 ADH4P08319 380 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 GDF1P27539 372 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 OPRK1P41145 380 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 TMPRSS3P57727 454 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 ERVK11-1P61568 191 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 SELENOTP62341 195 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 TGFBR3Q03167 851 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 Q6P435 159 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR73Q6P4I2 378 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 BRICD5Q6PL45 260 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 DTX1Q86Y01 620 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 FGFRL1Q8N441 504 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 DEFB119Q8N690 84 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4F5Q8NH21 305 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 DTD1Q8TEA8 209 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4F4Q96R69 305 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 NEU1Q99519 415 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PPQ1 181 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PPV4 95 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 H3BP45 60 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 HS3ST1O14792 307 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 TCAPO15273 167 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00614P0C842 121 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 HTD2P86397 168 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF585BQ52M93 769 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 DRAM1Q8N682 238 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 IFI44Q8TCB0 444 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 SDSLQ96GA7 329 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 UHRF2Q96PU4 802 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 U3KQA8 63 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 TRANK1O15050 2925 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-202ENST00000586851 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A0G2JRQ6 117 aa6.52□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1B0GV90 55 aa6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms