RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ARRDC1Q8N5I2 433 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 PIFOQ8TCI5 191 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SNAPC3Q92966 411 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 AJUBAQ96IF1 538 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 IFT46Q9NQC8 304 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 NLKQ9UBE8 527 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 GLS2Q9UI32 602 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 NUDT19A8MXV4 375 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SH2D1BO14796 132 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 JTBO76095 146 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFB6O95139 128 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 NXPH2O95156 264 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 DIRAS3O95661 229 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 CD3DP04234 171 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 TCRBP04435 133 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 FCGR3AP08637 254 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF735P0CB33 412 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 GABRA2P47869 451 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 RAB25P57735 213 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 TAS2R46P59540 309 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SSX2Q16385 188 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM185AQ8NFB2 350 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 BEST4Q8NFU0 473 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 OR56B4Q8NH76 319 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 PRR25Q96S07 402 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 PRRT1Q99946 306 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ZMAT4Q9H898 229 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 AK3Q9UIJ7 227 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 DISC1C4P0D8 188 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 RAB3DO95716 219 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ARG1P05089 322 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 CSN2P05814 226 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SPNP16150 400 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 GLRA1P23415 457 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ERVFRD-1P60508 538 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZS46 218 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 MOB1BQ7L9L4 216 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 MALSU1Q96EH3 234 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF488Q96MN9 340 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 GAFA1Q96PS6 74 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 NEURL2Q9BR09 285 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 C7orf66A4D0T2 115 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 DEGS1O15121 323 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SIGLEC5O15389 551 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 PRAF2O60831 178 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 LY86O95711 162 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 OR2H2O95918 312 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 HAND1O96004 215 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 MT-ND4P03905 459 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 HRH1P35367 487 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ECI1P42126 302 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 THBS3P49746 956 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 KIR2DS1Q14954 304 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 CDK10Q15131 360 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 GRK1Q15835 563 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms