RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553417.1

PRMT5-208, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 3

Gene PRMT5, Length 259 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-208	ENST00000553417	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	MYOD1	P15172	320 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ALOX5AP	P20292	161 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	HCCS	P53701	268 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ACTR3	P61158	418 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	PAX5	Q02548	391 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	RIPK1	Q13546	671 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	CDK5R1	Q15078	307 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	PSG5	Q15238	335 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ZNF124	Q15973	351 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	C15orf32	Q32M92	178 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ZNF691	Q5VV52	312 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	GPHB5	Q86YW7	130 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	STX19	Q8N4C7	294 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	PP6455	Q8WZ26	134 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	OPALIN	Q96PE5	141 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	CMC2	Q9NRP2	79 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	IL20	Q9NYY1	176 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417		R4GMQ9	66 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417		H3BNX3	289 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	SPDEF	O95238	335 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	SOX14	O95416	240 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	OXT	P01178	125 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	PRH1	P02810	166 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	OR9G9	P0C7N8	305 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	CPE	P16870	476 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	FUT3	P21217	361 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	MC5R	P33032	325 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	TTC32	Q5I0X7	151 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	C6orf183	Q5T699	404 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	SPSB1	Q96BD6	273 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	FUZ	Q9BT04	418 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	MRAS	O14807	208 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ATP8B1	O43520	1251 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	OR2J3	O76001	311 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	IGHV3-23	P01764	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ATF1	P18846	271 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	CCL1	P22362	96 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	MAGEA2	P43356	314 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	HTD2	P86397	168 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ROM1	Q03395	351 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	IL13RA2	Q14627	380 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	NECAP1	Q8NC96	275 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	C10orf35	Q96D05	121 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	RNF5	Q99942	180 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	RAB21	Q9UL25	225 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	FXYD1	O00168	92 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ARPC2	O15144	300 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	HBZ	P02008	142 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	TFPI2	P48307	235 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	KRTAP10-1	P60331	282 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ERVFC1-1	P60608	527 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	ZSCAN26	Q16670	478 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	PIGY	Q3MUY2	71 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRMT5-208	ENST00000553417	MORN2	Q502X0	79 aa		5.05	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms