RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 CD1BP29016 333 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 CEACAM6P40199 344 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 C11orf88Q6PI97 169 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 C3orf56Q8N813 242 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 RDH8Q9NYR8 311 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 ST8SIA5O15466 376 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 PROK1P58294 105 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 FBLN7Q53RD9 439 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 IGSF11Q5DX21 431 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM69Q5SWH9 247 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 MZT2AQ6P582 158 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 MOB3BQ86TA1 216 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 WFDC12Q8WWY7 111 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF702PQ9H963 129 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 RNF114Q9Y508 228 aa14.7□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 IGKV1D-33P01593 117 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 IGKV1-33P01594 117 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 CTXN2P0C2S0 81 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM11P17152 192 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 CBX5P45973 191 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 TAS2R20P59543 309 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 LSAMPQ13449 338 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 SPCS2Q15005 226 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 S1PR3Q99500 378 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.69□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 BET1O15155 118 aa14.68□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 FGF16O43320 207 aa14.68□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 SOX6P35712 828 aa14.68□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 HES1Q14469 280 aa14.68□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 CNIH2Q6PI25 160 aa14.68□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.68□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 Q8N6K4 173 aa14.68□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.68□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ISOC1Q96CN7 298 aa14.68□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 NABP2Q9BQ15 211 aa14.68□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 GINS4Q9BRT9 223 aa14.68□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.68□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.67□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 MOSP00540 346 aa14.67□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 OR3A3P47888 321 aa14.67□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 HOGA1Q86XE5 327 aa14.67□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 GAB2Q9UQC2 676 aa14.67□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 H3BMQ9 156 aa14.66□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 HPGDSO60760 199 aa14.66□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 AMY1AP04745 511 aa14.66□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 AMY2AP04746 511 aa14.66□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 BEST4Q8NFU0 473 aa14.66□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.66□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.66□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.66□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF221Q9UK13 617 aa14.66□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ANAPC10Q9UM13 185 aa14.66□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.66□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa14.65□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 OR5H14A6NHG9 310 aa14.65□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 TPPPO94811 219 aa14.65□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ELK1P19419 428 aa14.65□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 GPR12P47775 334 aa14.65□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 BLCAPP62952 87 aa14.65□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.65□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 C5orf56Q8N8D9 126 aa14.65□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.65□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.65□□□□□ -0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 HLA-DQB1P01920 261 aa14.64□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 PTHLHP12272 177 aa14.64□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.64□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 CITED1Q99966 193 aa14.64□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 OR2D2Q9H210 308 aa14.64□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 PROP1O75360 226 aa14.63□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 CT45A6P0DMU7 189 aa14.63□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 CT45A5P0DMU8 189 aa14.63□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 CT45A7P0DMV0 189 aa14.63□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 PRSS3P35030 304 aa14.63□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 ARPC4P59998 168 aa14.63□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.63□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.63□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 SNAPC3Q92966 411 aa14.63□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 SCPEP1Q9HB40 452 aa14.63□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 IFT46Q9NQC8 304 aa14.63□□□□□ -0.07
COPS7A-216ENST00000543170 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms