RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 SVOPQ8N4V2 548 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 GFI1Q99684 422 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 NABP2Q9BQ15 211 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 HSF4Q9ULV5 492 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 A0A0A6YYD4 124 aa7.07□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 PDCD5O14737 125 aa7.07□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 NBR2O15453 112 aa7.07□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 ELANEP08246 267 aa7.07□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 SCTP09683 121 aa7.07□□□□□ -1.28
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LMO3-222ENST00000540445 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
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LMO3-222ENST00000540445 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.07□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.07□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
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LMO3-222ENST00000540445 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.07□□□□□ -1.28
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LMO3-222ENST00000540445 RNF150Q9ULK6 438 aa7.07□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.06□□□□□ -1.28
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LMO3-222ENST00000540445 CT45A5P0DMU8 189 aa7.06□□□□□ -1.28
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LMO3-222ENST00000540445 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 OR8U1Q8NH10 309 aa7.06□□□□□ -1.28
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LMO3-222ENST00000540445 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 OR51J1Q9H342 316 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 PARP11Q9NR21 331 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 OR1A1Q9P1Q5 309 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 ZNF221Q9UK13 617 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 RAB26Q9ULW5 256 aa7.06□□□□□ -1.28
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LMO3-222ENST00000540445 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 A0A075B6Q4 140 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.05□□□□□ -1.28
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LMO3-222ENST00000540445 OR5H14A6NHG9 310 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 TRDCB7Z8K6 153 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 K7EIL1 84 aa7.05□□□□□ -1.28
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LMO3-222ENST00000540445 OR5M8Q8NGP6 311 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 RAB3CQ96E17 227 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 CLCC1Q96S66 551 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 AGMATQ9BSE5 352 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 FBXL15Q9H469 300 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.04□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa7.04□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.04□□□□□ -1.28
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