RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 ARL9Q6T311 187 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 LRRN1Q6UXK5 716 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 AAED1Q7RTV5 226 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 OR4D10Q8NGI6 311 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 MRAPQ8TCY5 172 aa3.34□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 KCTD7Q96MP8 289 aa3.34□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 PLEKHA1Q9HB21 404 aa3.34□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 PRR14LQ5THK1 2151 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 ETV6P41212 452 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 LINC00303Q3SY05 128 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 WDR38Q5JTN6 314 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 PVRIGQ6DKI7 326 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 MROQ9BYG7 248 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SLC7A10Q9NS82 523 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 FBXL3Q9UKT7 428 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 MPDU1O75352 247 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 RPP14O95059 124 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 NGFP01138 241 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 TTRP02766 147 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 PRSS1P07477 247 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 CST2P09228 141 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 CRYGSP22914 178 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 TDGF1P3P51864 188 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 CEACAM16Q2WEN9 425 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 Q499Y3 187 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SOSTQ9BQB4 213 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 MIXL1Q9H2W2 232 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SLC22A13Q9Y226 551 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 IGSF10Q6WRI0 2623 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SPTA1P02549 2419 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 PCNX1Q96RV3 2341 aa3.32□□□□□ -1.88
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